| 黄芩葡萄糖醛酸水解酶基因的克隆、生物信息学分析及表达 |
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| 引用本文： | 郭双双,程林,杨利民,韩梅.黄芩葡萄糖醛酸水解酶基因的克隆、生物信息学分析及表达[J].中国中药杂志,2015,40(22):4370-4377. |
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| 作者姓名： | 郭双双 程林 杨利民 韩梅 |
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| 作者单位： | 吉林农业大学中药材学院, 吉林长春 130118,吉林农业大学中药材学院, 吉林长春 130118,吉林农业大学中药材学院, 吉林长春 130118,吉林农业大学中药材学院, 吉林长春 130118 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31570327,31070292);国家科技支撑计划项目(2011BAI0301-02);吉林省科技成果转化项目(20130303089YY) |
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| 摘 要： | 该文从黄芩叶中提取总RNA,利用RT-PCR技术克隆了葡萄糖醛酸水解酶基因(sbGUS)的全长(GeneBank登录号KR364726)。该基因全长1584 bp,含有1个完整的开放阅读框,编码527个氨基酸,为不稳定亲水蛋白。生物信息学分析结果显示sbGUS编码蛋白分子质量为58.7248 kDa,等电点pI 5.55,含有信号肽和1个跨膜区,具有1个水解酶超级家族结构域1个未整合的转移糖苷酶催化结构域。二级结构中α-螺旋(Alpha helix)占25.62%,延伸链(extended strand)占28.84%,β-转角(Beta turm)占13.28%,无规卷曲(random coil)占32.26%。序列比对和系统进化分析表明, sbGUS基因与黄芩(BAA97804.1)核苷酸相似性为98.93%、氨基酸相似性为98.29%,在9个位置氨基酸不同。实时荧光定量PCR检测sbGUS在根中表达丰度最高,其次为花和茎,在叶中表达量最低。这为进一步鉴定sbGUS的功能及开展黄芩素的合成生物学研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 葡萄糖醛酸水解酶 生物信息学分析 黄芩素 克隆 |
| 收稿时间： | 5/8/2015 12:00:00 AM |
Cloning and bioinformatic analysis and expression analysis of beta-glucuronidase in Scutellaria baicalensis |
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| GUO Shuang-shuang,CHENG Lin,YANG Li-min and HAN Mei.Cloning and bioinformatic analysis and expression analysis of beta-glucuronidase in Scutellaria baicalensis[J].China Journal of Chinese Materia Medica,2015,40(22):4370-4377. |
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| Authors: | GUO Shuang-shuang CHENG Lin YANG Li-min and HAN Mei |
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| Affiliation: | College of Chinese materials, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,College of Chinese materials, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,College of Chinese materials, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China and College of Chinese materials, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China |
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