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| 金银花类药用植物IspE和IspH基因克隆和生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 汪周勇,蒋超,袁媛,陈平.金银花类药用植物IspE和IspH基因克隆和生物信息学分析[J].中国中药杂志,2013,38(1):32-36. |
| 作者姓名： | 汪周勇 蒋超 袁媛 陈平 |
| 作者单位： | 1. 中国中医科学院中药研究所,北京100700;武汉工业学院,湖北武汉430023 2. 中国中医科学院中药研究所,北京,100700 3. 武汉工业学院,湖北武汉,430023 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目 (81001605); 中药制药过程新技术国家重点实验室开放基金项目 (SKL2010M0101) |
| 摘 要： | 目的:克隆金银花类药用植物4-二磷酸胞苷-2-C-甲基赤藓糖激酶(4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase,IspE)和4-羟基-3-甲基-2-邻苯基二磷酸还原酶(4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase,IspH)基因,并对其基因序列、蛋白特性和转录活性进行分析、比较.方法:从忍冬Lonicera japonica转录组测序结果中分析获得了IspE,IspH基因.分别以忍冬、红白忍冬L.japonica var.chinensis、红腺忍冬L.hypoglauca和水忍冬L.dasystyla新鲜花蕾为材料,利用RT-PCR技术克隆获得了4种金银花类药用植物IspE和IspH基因的全长cDNA.运用生物信息学分析软件,预测编码蛋白的结构和功能,并通过RT-PCR检测IspE和IspH在忍冬、红白忍冬、红腺忍冬、水忍冬花蕾中的转录情况.结果:金银花类药用植物IspE基因含有1个完整的开放阅读框,长度为1 221 bp,编码406个氨基酸；IspH含有一个完整的开放阅读框,长度为1 380 bp,编码459个氨基酸.IspE和IspH均为非分泌蛋白,均定位于叶绿体中.RT-PCR分析结果表明在忍冬、红腺忍冬和水忍冬的花蕾中IspE,IspH基因的转录水平没有显著差异,但红白忍冬花蕾中IspE,IspH基因的转录水平均显著高于忍冬.结论:克隆获得忍冬、红白忍冬、红腺忍冬和水忍冬中IspE,IspH基因,并证实了其在不同金银花类药用植物中的表达,为进一步研究IspE,IspH基因对萜类化合物生物合成和花香气以及颜色的影响奠定了基础. |
| 关 键 词： | 忍冬 IspE IspH 生物信息学预测 |
| 收稿时间： | 7/9/2012 12:00:00 AM |
Cloning and bioinformatic analysis of IspE and IspH genes in Lonicera japonica and its substitutes |
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| WANG Zhou-yong,JIANG Chao,YUAN Yuan and CHEN Ping.Cloning and bioinformatic analysis of IspE and IspH genes in Lonicera japonica and its substitutes[J].China Journal of Chinese Materia Medica,2013,38(1):32-36. | |
| Authors: | WANG Zhou-yong JIANG Chao YUAN Yuan and CHEN Ping |
| Affiliation: | Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medicinal Sciences, Beijing 100700, China;Wuhan Polythechnic University, Wuhan 430023, China;Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medicinal Sciences, Beijing 100700, China;Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medicinal Sciences, Beijing 100700, China;Wuhan Polythechnic University, Wuhan 430023, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | Lonicera japonica IspE IspH bioinformatic analysis |
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