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丹参酮生物合成相关SmERF108转录因子的鉴定及其靶基因分析
引用本文:卢芷梅,季爱加.丹参酮生物合成相关SmERF108转录因子的鉴定及其靶基因分析[J].世界科学技术-中医药现代化,2022,24(5):170-179.
作者姓名:卢芷梅  季爱加
作者单位:广州中医药大学,广州中医药大学
基金项目:国家自然科学基金委员会青年基金(82003895):丹参“优形优质”相关转录因子NAC36的分子机制解析,负责人:季爱加;广东省基础与应用基础研究基金委员会广东省基础与应用基础研究基金项目(2019A1515110594):茉莉酸介导的SmERF128调控二萜合成分子机制研究,负责人:季爱加。
摘    要:目的 鉴定与丹参酮合成相关转录因子AP2/ERF家族中SmERF108转录因子,并分析转录因子SmERF108的靶基因。方法 利用生物信息学在线分析平台如NCBI、PFAM等分析SmERF108的序列特征;MEGA-X软件用于构建SmERF108与不同功能转录因子的系统进化树;拟南芥原生质体转化法鉴定SmERF108蛋白的亚细胞定位;通过实时荧光定量PCR(Real-time qPCR)对SmERF108基因在丹参不同器官和组织差异表达进行检测;利用酵母体系对SmERF108的转录激活活性进行探究并用酵母单杂技术确定其靶基因。结果 SmERF108具有典型的AP2/ERF保守结构域,属于ERF-B3亚组,系统进化树和保守基序分析显示SmERF108与丹参中SmERF128、青蒿中AaERF2亲缘关系较近且保守基序分布一致;亚细胞定位显示SmERF108蛋白定位于细胞核;SmERF108基因在周皮中表达最高,且呈现周皮(R1)>韧皮部(R2)>木质部(R3)的规律;酵母自激活验证SmERF108具有转录激活活性,同时酵母单杂交确认其能与关键酶基因SmCPS1启动子结合。结论 鉴定到丹参中一个新转录因子SmERF108,生物信息学分析及差异表达分析预测与丹参酮合成相关,分子互作初步证实靶基因为SmCPS1二萜环化酶。

关 键 词:丹参  转录因子  丹参酮  靶基因分析
收稿时间:2021/11/16 0:00:00
修稿时间:2022/6/16 0:00:00
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