| 四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征研究 |
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| 引用本文： | 李颖,付育红,原梅,董玲玲,黄海荣,李卫民,高基民.四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征研究[J].中华流行病学杂志,2015,36(4):374-378. |
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| 作者姓名： | 李颖 付育红 原梅 董玲玲 黄海荣 李卫民 高基民 |
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| 作者单位： | 325035 温州医科大学检验医学院生命科学学院 浙江省模式生物技术与应用重点实验室;首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所 国家结核病临床实验室;325035 温州医科大学检验医学院生命科学学院 浙江省模式生物技术与应用重点实验室;首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所 国家结核病临床实验室;首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所 国家结核病临床实验室;首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所 国家结核病临床实验室;325035 温州医科大学检验医学院生命科学学院 浙江省模式生物技术与应用重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81273144); 北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养计划项目(20133041) |
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| 摘 要： | 目的 探讨四川盆地(重庆、四川地区)流行的结核分枝杆菌(MTB)群体遗传学特征。方法 对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性(LSP)谱系鉴定, 采用χ2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复序列基因分型, 评价各位点的分辨力。构建N-J树分析其系统进化;构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构;采用分子方差分析不同谱系MTB的群体间遗传分化;采用贝叶斯模型计算菌株最近共祖年代。结果 通过LSP可将413株MTB分为两大谱系, 其中北京谱系占56.2%(232/413), 欧美谱系占43.8%(181/413)。两谱系MTB在人群中的分布(性别、年龄、民族以及菌株耐药性)差异无统计学意义(P>0.05)。北京谱系MTB的N-J树呈放射状分布, 最小跨度树中有72.4%(168/232)的菌株被划分到同一“克隆复合群”;欧美谱系MTB的N-J树呈枝状分布, 最小跨度树中呈现出多个“克隆复合群”。北京谱系MTB在该地区有显著的群体间遗传分化(FST=0.018 91, P<0.05), 而欧美谱系MTB群体间遗传分化不显著(FST=0.005 19, P>0.05)。欧美谱系MTB中最大菌株复合群的最近共祖年代为723(95%CI:517～946)年。结论 北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以“互相对抗”形式流行;两谱系MTB的群体间遗传分化存在差异;欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件(约720年前的战争)有关。
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| 关 键 词： | 结核分枝杆菌 长序列多态性 欧美谱系 群体遗传学 |
| 收稿时间： | 2014/10/4 0:00:00 |
Study on the population-genetics of Mycobacterium tuberculosis from Sichuan Basin in China |
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| Li Ying,Fu Yuhong,Yuan Mei,Dong Lingling,Huang Hairong,Li Weimin and Gao Jimin.Study on the population-genetics of Mycobacterium tuberculosis from Sichuan Basin in China[J].Chinese Journal of Epidemiology,2015,36(4):374-378. |
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| Authors: | Li Ying Fu Yuhong Yuan Mei Dong Lingling Huang Hairong Li Weimin and Gao Jimin |
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| Affiliation: | Zhejiang Provincial Key Laboratory for Technology and Application of Model Organisms, School of Laboratory Medicine and Life Science, Wenzhou Medical University, Wenzhou 325035, China;National Tuberculosis Clinical Laboratory of China, Beijing Tuberculosis and Thoracic Tumor Research Institute, Capital Medical University Affiliated Beijing Chest Hospital;Zhejiang Provincial Key Laboratory for Technology and Application of Model Organisms, School of Laboratory Medicine and Life Science, Wenzhou Medical University, Wenzhou 325035, China;National Tuberculosis Clinical Laboratory of China, Beijing Tuberculosis and Thoracic Tumor Research Institute, Capital Medical University Affiliated Beijing Chest Hospital;National Tuberculosis Clinical Laboratory of China, Beijing Tuberculosis and Thoracic Tumor Research Institute, Capital Medical University Affiliated Beijing Chest Hospital;National Tuberculosis Clinical Laboratory of China, Beijing Tuberculosis and Thoracic Tumor Research Institute, Capital Medical University Affiliated Beijing Chest Hospital;Zhejiang Provincial Key Laboratory for Technology and Application of Model Organisms, School of Laboratory Medicine and Life Science, Wenzhou Medical University, Wenzhou 325035, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Mycobacterium tuberculosis Large Sequence Polymorphism Euro-American lineage Population genetics |
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