| miR-542-3p对骨肉瘤细胞侵袭能力的影响及其靶基因预测 |
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| 引用本文： | 林希圣,郑超,杨柳,罗卓荆.miR-542-3p对骨肉瘤细胞侵袭能力的影响及其靶基因预测[J].骨科,2018,9(1):50-55. |
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| 作者姓名： | 林希圣 郑超 杨柳 罗卓荆 |
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| 作者单位： | 710032 西安，空军军医大学（第四军医大学）西京医院骨科,710032 西安，空军军医大学（第四军医大学）西京医院骨科,710032 西安，空军军医大学（第四军医大学）西京医院骨科,710032 西安，空军军医大学（第四军医大学）西京医院骨科 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重点项目（81730065） |
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| 摘 要： | 目的 明确miR-542-3p对骨肉瘤细胞系HOS和SAOS2细胞侵袭能力的影响，通过生物信息学建立miR-542-3p靶基因调控网络，并探讨其潜在作用靶点。方法 使用miR-542-3p mimics转染HOS和SAOS2细胞，同时设立正常组（未转染）及阴性对照组（转染miR-neg mimics），Transwell小室试验检测转染后细胞的侵袭能力。通过美国国立生物信息中心（NCBI）基因表达共享数据库（GEO）联合GEO2R平台，获取并分析miRNA-542-3p与miR-neg转染的U2OS细胞的基因表达谱数据及其差异表达基因，进而使用miRNA预测数据库及Cytoscape软件，预测并建立miR-542-3p靶基因调控网络。实时荧光定量PCR验证miR-542-3p转染HOS和SAOS2细胞后，部分预测目标靶基因的mRNA表达水平变化。结果 miR-542-3p干预组HOS和SAOS2细胞的侵袭能力较正常组和阴性对照组明显降低（P均＜0.05）。数据库差异基因分析表明，miR-542-3p与miR-neg转染的U2OS细胞的表达差异基因共有417个，其中185个基因表达下调。miRNA预测数据库预测的266个靶基因中，有14个与差异基因分析中得到的表达下调基因重合。实时荧光定量PCR分析得出，ILK、TBPL1、ETS1这3个预测靶基因在miR-542-3p干预组中的表达水平显著低于阴性对照组，差异均有统计学意义（P均＜0.05）。结论 miR-542-3p通过下调ILK、TBPL1、ETS1显著抑制骨肉瘤细胞的侵袭能力。
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| 关 键 词： | 骨肉瘤 侵袭 微小RNA |
| 收稿时间： | 2017/11/6 0:00:00 |
Effect of miR-542-3p on invasion of osteosarcoma cells and the target genes prediction |
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| LIN Xi-sheng,ZHENG Chao,YANG Liu and LUO Zhuo-jing.Effect of miR-542-3p on invasion of osteosarcoma cells and the target genes prediction[J].Orthopaedics,2018,9(1):50-55. |
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| Authors: | LIN Xi-sheng ZHENG Chao YANG Liu and LUO Zhuo-jing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Osteosarcoma Invasion miRNA |
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