基于生物信息学的Prohibitin在乳腺癌中的表达及意义 |
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引用本文: | 李越,周晓艳,刘佳丽,袁晓红,何谦.基于生物信息学的Prohibitin在乳腺癌中的表达及意义[J].临床检验杂志,2019,37(3):216-221. |
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作者姓名: | 李越 周晓艳 刘佳丽 袁晓红 何谦 |
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作者单位: | 西安交通大学第二附属医院检验科,西安,710004;西安交通大学第二附属医院检验科,西安,710004;西安交通大学第二附属医院检验科,西安,710004;西安交通大学第二附属医院检验科,西安,710004;西安交通大学第二附属医院检验科,西安,710004 |
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基金项目: | 国家青年科学基金(8160031466);陕西省国际合作项目(2012KW-35) |
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摘 要: | 目的通过生物信息学高通量多组学数据库分析浸润性乳腺癌组织中prohibitin(PHB)的表达及其临床意义。方法下载TCGA和METABRIC乳腺癌数据,应用多种工具比较癌组织和癌旁组织中PHB表达情况,并分析PHB表达与乳腺癌患者临床病理特征及预后之间的相关性,进行PHB蛋白互相作用预测及功能分析。结果 PHB在多种癌组织中较癌旁组织高表达,乳腺癌中PHB基因突变和表达量改变比例较高;PHB基因表达对于乳腺癌具有良好的诊断效能(P0.01);PHB表达与乳腺癌患者ER受体、HER2、PAM50分型、肿瘤纯度等指标有关(P0.05)。生存分析表明,乳腺癌PHB高表达是影响乳腺癌的独立危险因素(P0.01)。HRAS、KSR1、ARAF与PHB相互作用且相关性较高,在乳腺癌组织中可见表达改变。结论 PHB在乳腺癌、卵巢癌等多种癌组织中表达升高,并且PHB高表达明显影响乳腺癌患者预后,PHB基因表达对乳腺癌的诊断效能较好,可作为乳腺癌诊断、预后的潜在标志物。
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关 键 词: | 乳腺癌 prohibitin 预后 生物信息学 |
收稿时间: | 2018/12/11 0:00:00 |
修稿时间: | 2019/3/17 0:00:00 |
Expression and clinical significance of prohibitin in breast cancer based on bioinformatics |
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Abstract: | |
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Keywords: | breast cancer prohibitin prognosis bioinformatics |
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