欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1 理化性质与结构的生物信息学分析 |
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引用本文: | 曹淑芬,李,文,何,颖,邹泽红,李林梅,艾云灿.欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1 理化性质与结构的生物信息学分析[J].中国免疫学杂志,2016,32(9):1291. |
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作者姓名: | 曹淑芬 李 文 何 颖 邹泽红 李林梅 艾云灿 |
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摘 要: | 目的:运用生物信息学相关软件,预测欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1 的理化性质和结构,为Lig v 1 重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法:查询文献获得Lig v 1 的氨基酸序列,运用生物信息学软件分析其理化性质(ProtParam)、信号肽(SignalP 4.1 Server)、跨膜区(TMHMM Server v.2.0)、二级结构(GOR4)、MHC域类抗原表位(NetMHC域2.2 Server)、B 细胞抗原表位(ProteanTM 5.01)以及系统发生树(MEGA 6)。结果:Lig v 1 在大肠杆菌中稳定性较好,不存在信号肽与跨膜区;二级结构中无规则卷曲占大多数;Lig v 1 潜在MHC域类抗原表位为30 ~44 区域;B 细胞抗原表位既具有连续的氨基酸序列,也具有不连续的氨基酸序列;Lig v 1 与欧洲白蜡以及木犀榄的同源蛋白进化距离最近。结论:大肠杆菌是适合重组Lig v 1 的表达系统,Lig v 1 抗原表位分析为低过敏原性改造提供参考。
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关 键 词: | 欧洲女贞 过敏原 生物信息学软件 Lig v 1 抗原表位 |
In silico prediction for physicochemical properties and structure of major pollen allergen Lig v 1 in Ligustrum vulgare |
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Abstract: | |
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