细粒棘球绦虫多价EgA31-EgG1Y162 抗原序列优化分析 |
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引用本文: | 张 杰,李玉娇,张峰波,孔慧芳,周晓涛,王红英,丁剑冰.细粒棘球绦虫多价EgA31-EgG1Y162 抗原序列优化分析[J].中国免疫学杂志,2020,36(1):19. |
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作者姓名: | 张 杰 李玉娇 张峰波 孔慧芳 周晓涛 王红英 丁剑冰 |
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摘 要: | 目的:将优化的EgA31-EgG1Y162抗原基因构建于pET30a上,诱导蛋白表达,SDS-PAGE鉴定蛋白表达效果,用生物信息学软件分析优化的EgA31-EgG1Y162抗原序列,为构建高效的疫苗奠定理论基础。方法:运用ProtParam,DNAstar,E.coli Codon Usage Analyzer等多种生物信息学软件分析优化后EgA31-EgG1Y162蛋白的理化性质,比较其优化前后序列的异同点及抗原表位分布情况等。结果:EgA31-EgG1Y162蛋白属于不稳定性蛋白且亲水性蛋白,通过网上在线软件分析,优化序列的密码子中不含利用率低的密码子。表位预测分析确定6个T细胞表位的氨基酸区域1~15、86~97、177~193、359~388、305~319、344~358和7个B细胞表位为102~112、172~204、318~334、343~353、394~409、415~431、443~458。结论:多价EgA31-EgG1y162融合抗原蛋白的优化序列中不含利用率低的密码子,且T和B细胞表位未受影响,为重组蛋白体外的有效表达奠定实验基础,对包虫病的多价表位疫苗研究具有重要的指导作用。
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