鸭肠炎病毒感染鸭脾脏的转录组分析 |
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引用本文: | 吴良涛,郑敏,华敏,万润,程振涛,周碧君,文明.鸭肠炎病毒感染鸭脾脏的转录组分析[J].病毒学报,2017,33(3):425-434. |
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作者姓名: | 吴良涛 郑敏 华敏 万润 程振涛 周碧君 文明 |
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作者单位: | 贵州大学动物科学学院,贵阳,550025;贵州大学动物科学学院,贵阳550025;贵州大学动物疫病研究所,贵阳550025;贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室,贵阳550025 |
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摘 要: | 为探明鸭肠炎病毒(Duck enteritis virus,DEV)感染鸭脾脏的转录组情况,本研究以DEV GZ株经腿部肌肉接种50d鸭,于接种后66h采集鸭脾组织样本,提取总RNA,采用Illumina HiSeq 2000TM对试验组和对照组样品进行测序,筛选DEV感染鸭脾脏组织的差异表达基因,对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG信号通路分析。结果显示,差异表达基因共511个,其中表达上调312个,表达下调199个。GO功能分类结果显示,差异表达基因主要涉及氧运输、整合素活化、补体激活等生物学过程,胞外区、血红蛋白复合物、细胞外间隙等细胞组分,氧转运活动、氧结合、核糖体的结构成分等分子功能。KEGG分析表明这些差异表达基因参与ECM受体相互作用、核糖体、CAMs、JAK-STAT信号通路、细胞因子和细胞因子受体相互作用、PPAR信号通路、神经活性配体/受体相互作用信号通路。本研究为深入探究DEV与鸭脾脏组织互作、宿主抗病机制及相关功能基因的筛选奠定了基础。
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关 键 词: | 鸭肠炎病毒(DEV) 鸭脾脏 转录组测序 |
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