| 人工微生物混菌系统机制解析中的组学应用及进展 |
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| 引用本文： | 国陶红,宋馨宇,陈磊,张卫文.人工微生物混菌系统机制解析中的组学应用及进展[J].生物工程学报,2022,38(2):460-477. |
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| 作者姓名： | 国陶红 宋馨宇 陈磊 张卫文 |
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| 作者单位： | 天津大学 化工学院合成微生物学实验室, 天津 300072;教育部合成生物学前沿科学中心, 天津 300072;教育部系统生物工程重点实验室, 天津 300072;天津大学 化工学院合成微生物学实验室, 天津 300072;教育部合成生物学前沿科学中心, 天津 300072;教育部系统生物工程重点实验室, 天津 300072;天津大学 生物安全战略研究中心, 天津 300072 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划（2019YFA0904600，2020YFA0906800，2018YFA0903000，2018YFA0903600）；国家自然科学基金（31901016，91751102，31770035，31770100，31972931，21621004，31370115，3140217） |
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| 摘 要： | 人工微生物混菌系统的生物工程应用价值日益受到重视,使得对于混菌系统中成员菌间的相互作用机制研究也成为近年来的一个热点。其研究结果一方面可以为现有人工混菌系统的进一步优化提供理论依据,另一方面也为全新混菌系统的人工构建提供新的思路和策略,进而促进人工微生物混菌系统未来规模化应用。基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等研究方法能够高通量分析各种生物分子、提供大量的数据与信息,多组学分析可以获得混菌系统中细胞的“全景”,在揭示人工微生物混菌系统中各个成员间的相互作用的研究中有着特殊的意义。文中综述了近年来多种组学技术在人工微生物混菌系统机制解析中的应用及研究进展,从代谢网络、能量代谢、信号转导、膜转运、胁迫响应、混菌系统的稳定性以及结构合理性等方面探讨混菌系统机制解析的最新进展,以期为利用合成生物学、基因组编辑等新兴生物技术改造微生物混菌系统实现其工程化应用提供理论依据。
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| 关 键 词： | 混菌系统 相互作用 组学 机制解析 |
| 收稿时间： | 2021/3/19 0:00:00 |
Using OMICS technologies to analyze the mechanisms of synthetic microbial co-culture systems: a review |
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| GUO Taohong,SONG Xinyu,CHEN Lei,ZHANG Weiwen.Using OMICS technologies to analyze the mechanisms of synthetic microbial co-culture systems: a review[J].Chinese Journal of Biotechnology,2022,38(2):460-477. |
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| Authors: | GUO Taohong SONG Xinyu CHEN Lei ZHANG Weiwen |
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| Affiliation: | Laboratory of Synthetic Microbiology, School of Chemical Engineering & Technology, Tianjin University, Tianjin 300072, China;Frontier Science Center for Synthetic Biology and Key Laboratory of Systems Bioengineering, Ministry of Education of China, Tianjin 300072, China;Laboratory of Systems Bioengineering, Ministry of Education of China, Tianjin 300072, China;Laboratory of Synthetic Microbiology, School of Chemical Engineering & Technology, Tianjin University, Tianjin 300072, China;Frontier Science Center for Synthetic Biology and Key Laboratory of Systems Bioengineering, Ministry of Education of China, Tianjin 300072, China;Laboratory of Systems Bioengineering, Ministry of Education of China, Tianjin 300072, China;Center for Biosafety Research and Strategy, Tianjin University, Tianjin 300072, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | co-culture system interaction OMICS mechanism analysis |
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