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猪繁殖与呼吸综合征病毒S1株基因组序列测定和分析
引用本文:李玉峰,姜平,许家荣,蒋文明.猪繁殖与呼吸综合征病毒S1株基因组序列测定和分析[J].Virologica Sinica,2006,21(5):490-493.
作者姓名:李玉峰  姜平  许家荣  蒋文明
作者单位:南京农业大学动物医学院 江苏南京210095
基金项目:国家自然科学基金(30270990),教育部优秀青年教师资助计划(20030307012),新世纪优秀人才资助计划(NCET-04-0502),教育部重点基金项目(104101)
摘    要:应用RT-PCR方法分段扩增出PRRSV上海分离株S1毒株的4条基因大片段,扩增后的产物分别克隆于pCR-XL-TOPO载体鉴定后测序,同时应用RACE方法对S1毒株的3′和5′基因末端进行了成功的扩增并克隆于pMD-18T载体进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到PRRSVS1株全基因组cDNA序列。测序结果表明PRRSVS1株基因组全长15441bp,包含9个开放式阅读框,5′UTR含有189nt,3′端UTR含有181nt,其中包含30ntPoly(A)。基因组序列分析结果显示该病毒与ATCCVR-2332和BJ-4分离株的核苷酸同源性分别99.5%和99.6%。与另一国内分离株CH-1a的核苷酸同源性为90.8%。

关 键 词:PRRSV  基因组  序列测定和分析
收稿时间:2006-04-06
修稿时间:2006-05-25

Genomic Sequencing of S1 Strain of a Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolate
LI Yu-feng, JIANG Ping, XU Jia-rong, JIANG Wen-ming.Genomic Sequencing of S1 Strain of a Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolate[J].中国病毒学(英文版),2006,21(5):490-493.
Authors:LI Yu-feng  JIANG Ping  XU Jia-rong  JIANG Wen-ming
Affiliation:College of Animal Medicine, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China
Abstract:
Keywords:PRRSV  Genome  Sequencing and analysis
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