| 利用土壤宏基因组技术定向筛选抗生素产生菌的方法学建立 |
| |
| 引用本文： | 栗若兰,郑智慧,路新华,张华,蒋沁.利用土壤宏基因组技术定向筛选抗生素产生菌的方法学建立[J].微生物学通报,2011,38(7):1125-1130. |
| |
| 作者姓名： | 栗若兰 郑智慧 路新华 张华 蒋沁 |
| |
| 作者单位： | 华北制药集团新药研究开发中心微生物药物国家研究工程中心,河北石家庄,050015 |
| |
| 基金项目： | 国家科技重大新药创制专项(No. 2010ZX09401-403); 国家科技重大新药创制专项(No. 2008ZX 09401-05); 国家科技重大新药创制专项(No. 2009ZX9302-004) |
| |
| 摘 要： | 为了快速从土壤中定向筛选抗生素产生菌, 本研究利用宏基因组技术进行了土壤中抗生素产生菌快速筛选方法的探索。对6 种不同土质的土壤利用液氮冷冻法提取土壤基因组DNA 并用PVPP柱层析法进行纯化, 每克湿土可得到32.25?61.25 μg DNA, 片段大小为23 kb左右, 说明宏基因组DNA样品完整, 16S rDNA的 PCR结果证明了该基因组DNA纯度可用于后期的分子操作。利用Herbimycin产生菌掺入法进行了抗生素产生菌筛选方法学的验证。结果证明, 每克湿土掺入103个Herbimycin产生菌时, 利用Herbimycin合成基因簇的特定引物即可从所提取的土壤基因组DNA中扩增出目标条带, 并且可以利用传统菌种分离方法从土壤中重新分离出来被掺入到土壤的Herbimycin产生菌。这些结果证明本研究建立的定向抗生素产生菌筛选方法, 具有快捷、灵敏的特点, 大大减少传统筛选方法的工作强度和时间, 为微生物新药的研发建立一种全新的研究方法。
|
| 关 键 词： | 土壤宏基因组 DNA提取 DNA纯化 基因筛选 |
A method of screening for antibiotic microorganism producing strains from soil by metagenomics |
| |
| LI Ruo-Lan,ZHENG Zhi-Hui,LU Xin-Hu,ZHANG Hua and JIANG Qin.A method of screening for antibiotic microorganism producing strains from soil by metagenomics[J].Microbiology,2011,38(7):1125-1130. |
| |
| Authors: | LI Ruo-Lan ZHENG Zhi-Hui LU Xin-Hu ZHANG Hua and JIANG Qin |
| |
| Affiliation: | New Drug Research and Development Center of North China Pharmaceutical Corporation, National Microbial Medicine Engineering Research Center, Shijiazhuang, Hebei 050015, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Soil metagenomics DNA extraction DNA purification Gene screening |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《微生物学通报》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《微生物学通报》下载全文 |
|
