| miRNAs芯片数据的聚类分析与羽扇豆醇抗癌途径预测 |
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| 引用本文： | 刘大川,代翠红,徐德昌.miRNAs芯片数据的聚类分析与羽扇豆醇抗癌途径预测[J].生物信息学,2011,9(4):263-268. |
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| 作者姓名： | 刘大川 代翠红 徐德昌 |
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| 作者单位： | 哈尔滨工业大学食品科学与工程学院,哈尔滨,150090 |
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| 基金项目： | 国家科技部科研院所技术开发研究专项资金项目(KCSTE-2000-JKZX-021,NCSTE-2007-JKZX-022); 国家自然科学基金项目(30771371); 国家863项目(2001AA231091,2004AA231071); 黑龙江省科技攻关项目(WB07C02); 黑龙江省自然科学基金项目(2004C0314); 哈尔滨工业大学科学研究基金项目(HIT.2003.38)部分资助 |
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| 摘 要： | 羽扇豆醇是一种植物天然提取物,具有高效低毒的抗癌活性,对于药物开发领域有很高价值。目前对其抗癌机制还不是十分明确。使用TaqMan MicroRNA Assay芯片技术,从羽扇豆醇处理的hela细胞中miRNA的差异表达入手,探索扇豆醇抗癌分子途径。运用聚类分析等统计学方法和targetscan,RNAfold等序列分析工具进行信号组分的预测筛选,再结合对NC-BI,Gene Ontology等大型生物信息数据库的检索,最终在生物信息学层面上,分析得到hela细胞中羽扇豆醇抗癌的分子调控途径,即以受体酪氨酸激酶ERBB4介导的,hsa-miR-23b,hsa-miR-200b等几种miRNA参与的分子通路。
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| 关 键 词： | 羽扇豆醇 宫颈癌 miRNA ERBB4 生物芯片 |
Cluster analysis of miRNAs microarray data and prediction of lupeol anti- cancer path |
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| LIU Da-chuan,DAI Cui-hong,XU De-chang.Cluster analysis of miRNAs microarray data and prediction of lupeol anti- cancer path[J].China Journal of Bioinformation,2011,9(4):263-268. |
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| Authors: | LIU Da-chuan DAI Cui-hong XU De-chang |
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| Affiliation: | LIU Da-chuan,DAI Cui-hong,XU De-chang (School of Food Science and Engineering,Harbin Institute of Technology,Harbin 150090,China) |
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| Abstract: | Lupeol is an extract from natural plants that has an effective and low-toxic anticancer function.It is of very high value to the drug exploitation.However,the mechanism of its anticancer function still remains unclear.We analyzed the differential expression of miRNA from hela cells which are pretreated with lupeol to investigate the anticancer molecular paths of lupeol.The method of TaqMan MicroRNA Assay was employed through our research.Datas are analyzed with the method of cluster analysis.Targetscan and ... |
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| Keywords: | lupeol cervical cancer miRNA ERBB4 biochip |
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