| 基于全基因组序列的污染事件中椰毒假单胞菌酵米面亚种溯源分析 |
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| 引用本文： | 陈荣桥,陈汉金,冼燕萍,侯向昶,朱文信,郭燕华,胡均鹏,梁 明,刘冬虹,吴玉銮.基于全基因组序列的污染事件中椰毒假单胞菌酵米面亚种溯源分析[J].食品安全质量检测技术,2021,12(9):3854-3859. |
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| 作者姓名： | 陈荣桥 陈汉金 冼燕萍 侯向昶 朱文信 郭燕华 胡均鹏 梁 明 刘冬虹 吴玉銮 |
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| 作者单位： | 广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院,广州质量监督检测研究院 |
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| 基金项目： | 广东省科技计划项目（2019B020208008）；国家市场监督管理总局研究项目 |
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| 摘 要： | 摘 要：目的 对湿米粉与淀粉制品（统称为“湿粉”）及其原料米中分离的椰毒假单胞菌酵米面亚种进行溯源分析。方法 采用GB/T 4789.29—2003在14份湿粉及其原料米中分离出34株唐菖蒲伯克霍尔德氏
菌并进行菌株全基因组重测序，以Burkholderia_gladioli_Co14作为参比基因，基于单核苷酸多态性（SNP）数据构建进化树，分析不同菌株的同源关系。结果 来源于相同产地标识的样品的菌株呈现较好聚类；来源于同一生产企业的湿粉和碎米样品的菌株具有高度同源关系。结论 提示原料米中椰毒假单胞菌酵米面亚种的基因组序列与产地溯源具有较大的相关性，在湿粉生产加工过程中存在椰毒假单胞菌酵米面亚种污染传递的风险。
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| 关 键 词： | 椰毒假单胞菌酵米面亚种 湿粉及其原料米 全基因组序列 进化树 溯源 |
| 收稿时间： | 2021/1/20 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/5/26 0:00:00 |
Traceability analysis of Pseudomonas cocovenenans subsp. Farino fermentans in pollution events based on whole genome sequence |
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| CHEN Rong-Qiao,CHEN Han-Jin,XIAN Yan-Ping,HOU Xiang-Chang,ZHU Wen-Xin,GUO Yan-Hu,HU Jun-Peng,LIANG Ming,LIU Dong-Hong,WU Yu-Luan.Traceability analysis of Pseudomonas cocovenenans subsp. Farino fermentans in pollution events based on whole genome sequence[J].Food Safety and Quality Detection Technology,2021,12(9):3854-3859. |
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| Authors: | CHEN Rong-Qiao CHEN Han-Jin XIAN Yan-Ping HOU Xiang-Chang ZHU Wen-Xin GUO Yan-Hu HU Jun-Peng LIANG Ming LIU Dong-Hong WU Yu-Luan |
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| Affiliation: | Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute,Guangzhou Quality Supervision and Testing Institute |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pseudomonas cocovenenans subsp Farinofermentans Wet rice noodles and its raw rice whole genome sequence phylogenetic tree Traceability |
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