| 乳酸乳球菌乳酸亚种的~(m6)A甲基化差异研究 |
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| 引用本文： | 郑慧娟,李伟程,赵飞燕,蔡虹宇,孙志宏,张和平.乳酸乳球菌乳酸亚种的~(m6)A甲基化差异研究[J].中国食品学报,2021,21(5):14-22. |
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| 作者姓名： | 郑慧娟 李伟程 赵飞燕 蔡虹宇 孙志宏 张和平 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学；乳品生物技术与工程教育部重点实验室；农业农村部乳制品加工重点实验室；内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31430066， 31622043） |
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| 摘 要： | 乳酸乳球菌乳酸亚种是常用的工业发酵剂菌种,具有较高的经济价值。乳酸乳球菌乳酸亚种BL19与IMAU10978的发酵特性存在较大差异,其中BL19具有良好发酵特性。本文比较2株存在明显发酵特性差异的乳酸乳球菌乳酸亚种BL19与IMAU10978,从基因组与~(m6)A甲基化角度探究2株菌的发酵差异化特性。通过单分子实时(SMRT)测序技术对BL19与IMAU10978进行全基因组测序与~(m6)A甲基化鉴定,并结合NCBI全基因组数据,比较不同菌株的功能基因差异和BL19与IMAU10978的~(m6)A甲基化差异。比较基因组分析表明:试验菌株的平均核苷酸一致性高达98.24%,且其功能基因不存在明显差异,均以碳水化合物和氨基酸代谢等为主。甲基化分析显示:IMAU10978与BL19的肽转运载体、PTS系统和2,3-丁二醇脱氢酶等相关基因的~(m6)A甲基化存在明显差异。本研究分析了BL19与IMAU10978的基因组与~(m6)A甲基化,发现2株菌的亲缘关系近且功能基因较为相似,~(m6)A甲基化差异可能是导致发酵特性差异的重要原因。此外,还初步探究工业发酵剂菌株基因组的表观修饰,为工业菌株的选育提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 乳酸乳球菌乳酸亚种 比较基因组学 m6A甲基化 |
Studies on the Difference about N6-Methyladenine Methylation of Lactococcus lactis subsp. lactis |
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| Abstract: | Studies on the Difference about N6-Methyladenine Methylation of Lactococcus lactis subsp. lactis |
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