| 分子对接技术筛选菲律宾蛤仔抗炎肽 |
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| 引用本文： | 姜玉,林海生,秦小明,高加龙,曹文红,陈忠琴,郑惠娜,伍彬.分子对接技术筛选菲律宾蛤仔抗炎肽[J].食品与发酵工业,2023(13):144-151. |
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| 作者姓名： | 姜玉 林海生 秦小明 高加龙 曹文红 陈忠琴 郑惠娜 伍彬 |
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| 作者单位： | 1. 广东海洋大学食品科技学院;2. 广东省水产品加工与安全重点实验室广东普通高等学校水产品深加工重点实验室国家贝类加工技术研发分中心(湛江)南海生物资源开发与利用协同创新中心 |
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| 基金项目： | 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-49)； |
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| 摘 要： | 基于分子对接技术筛选菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)来源的具有抗炎作用的活性肽。采用三氯乙酸-丙酮沉淀法提取菲律宾蛤仔蛋白质，通过双向凝胶电泳(2-dimensional electro phoresis, 2-DE)技术和液质联用(LC-MS/MS)技术分离和鉴定其蛋白质，借助BIOPEP-UWM在线工具对主要蛋白进行虚拟酶解，使用PeptideRanker和ToxinPred等程序对肽段进行评分和理化性质分析；利用Discovery studio 2019和AutoDock Vina软件进行分子对接筛选潜在抗炎肽片段，探讨人工合成抗炎肽对LPS诱导的RAW264.7细胞炎症的改善作用。结果表明，原肌球蛋白和组蛋白为肌肉组织的主要蛋白质。选用原肌球蛋白作为底物，通过虚拟酶解和分子对接筛选出8种潜在的新颖活性肽。其中DQTF与TLR2和TLR4分别存在7个氨基酸残基和8个氨基酸残基结合位点，而GYTR与TLR2分子中的10个氨基酸残基和TLR4分子中的7个氨基酸残基紧密结合(结合能均低于-5 kcal/mol),表明其是潜在的抗炎肽。活性验证结果表明，2条合...
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| 关 键 词： | 菲律宾蛤仔 原肌球蛋白 虚拟酶解 分子对接 RAW264.7细胞 抗炎寡肽 |
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