| 蓖麻LEA基因家族的全基因组鉴定、分类及其进化分析 |
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| 引用本文： | 邹智,黄启星,安锋.蓖麻LEA基因家族的全基因组鉴定、分类及其进化分析[J].中国油料,2013(6):637-643. |
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| 作者姓名： | 邹智 黄启星 安锋 |
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| 作者单位： | [1]中国热带农业科学院橡胶研究所／农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,海南儋州571737 [2]中国热带农业科学院热带生物技术研究所／农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南海口571101 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31100460）;海南省重点科技项目（90107）;海南省自然科学基金（312026）;中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项（1630022011014） |
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| 摘 要： | 基于已公布的基因组和EST数据对蓖麻LEA基因家族进行全面鉴定和系统命名，并在此基础上分析了其基因结构、生化特征、进化关系和表达特性。结果显示，蓖麻基因组中存在27个LEA基因，分属于LEA_1、LEA_2、LEA_3、LEA_4、LEA_5、LEA_6、dehydrin和SMP 8个亚家族，它们散布于24条scaffold上，含有0～2个内含子不等，且其中有3个基因存在可变剪接；根据编码蛋白中的Pfam结构域类型及其进化关系，将这些LEA基因依次命名为RcLEA1-1和-2、RcLEA2-1和-2、RcLEA3-1至-3、RcLEA4-1至-7、RcLEA5-1和-2、RcLEA6-1和-2、RcLEA7-1至-5和RcLEA8-1至-4；利用BLAT分析基因表达谱显示，在叶片、花、II/III期胚乳、V/VI期胚乳和种子等组织中，所有RcLEA基因都有表达；启动子分析表明，RcLEA基因的启动子区富含LTRE、ABRE、MYC、MYB和W-box等逆境应答相关顺式作用元件。
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| 关 键 词： | 蓖麻 全基因组 LEA基因家族 分类 进化分析 |
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