耐辐射奇球菌未知功能基因DR_2566的克隆与生物信息学分析 |
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引用本文: | 何彬彬,李斌元,马云,杨杰,王三虎,苏泽红,唐艳,何淑雅.耐辐射奇球菌未知功能基因DR_2566的克隆与生物信息学分析[J].辐射研究与辐射工艺学报,2013(2):2-7. |
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作者姓名: | 何彬彬 李斌元 马云 杨杰 王三虎 苏泽红 唐艳 何淑雅 |
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作者单位: | 南华大学公共卫生学院;南华大学生物化学与分子生物学教研室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81272993);湖南省研究生科研创新项目(CX2012B386)资助 |
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摘 要: | 克隆与辐射抗性相关但功能未知的新基因DR_2566,并应用生物信息学初步探讨其功能。应用PCR技术从耐辐射奇球菌基因组中扩增DR_2566基因全长ORF,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过限制性酶切及测序进行鉴定。应用生物信息学初步分析其染色体定位、蛋白序列、结构域及功能。成功克隆了耐辐射球菌未知功能基因DR_2566,生物信息学分析显示此基因全长为507 bp,编码168个氨基酸,其编码蛋白的理论分子量为19.136KDa,三级结构预测显示DR_2566蛋白质具有短修复内切酶性质。成功克隆了耐辐射奇球菌基因DR_2566全长ORF,生物信息学预测DR_2566蛋白可能具有错配修复作用。
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关 键 词: | 耐辐射球菌 DR2566基因 基因克隆 生物信息学 |
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