| SIMCA法用于从非同源蛋白一级序列预测其结构类 |
| |
| 引用本文： | 高守国.SIMCA法用于从非同源蛋白一级序列预测其结构类[J].计算机与应用化学,2004,21(5):714-716. |
| |
| 作者姓名： | 高守国 |
| |
| 作者单位： | 东南大学公共卫生学院,江苏,南京,210009 |
| |
| 摘 要： | 蛋白质结构类的正确识别对于其三级结构预测具有十分重要的意义，有必要引入先进的算法提高预测精度。使用SIMCA法处理氨基酸组成、自相关系数提取的特征参数以及氨基酸对含量，进行了蛋白质结构类的预测。采用Miyazawa和Jerni—gan的疏水值时，All-α、All-β、αβ类的白检验的精度为89％、91％、89％，它检验的精度分别为74％、87％、91％；引入氨基酸对含量后，All-α、All-β、αβ类白检验精度为86％、89％、90％，它检验的精度为77％、88％、93％。SIMCA的预测结果好于Bayesian识别函数法，氨基酸对的引入可以提高预测精度。
|
| 关 键 词： | 结构类预测 SIMCA 氨基酸对含量 |
| 文章编号： | 1001-4160(2004)05-714-716 |
SIMCA method and application in prediction of protein secondary structural classes |
| |
| GAO ShouGuo.SIMCA method and application in prediction of protein secondary structural classes[J].Computers and Applied Chemistry,2004,21(5):714-716. |
| |
| Authors: | GAO ShouGuo |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | prediction of secondary structural Classes SIMCA amino acids pairs compositions |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
