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串联质谱谱库搜索鉴定技术综述
引用本文:王耀君,孙世伟,卜东波,刘金刚.串联质谱谱库搜索鉴定技术综述[J].计算机工程,2012,38(7):269-272.
作者姓名:王耀君  孙世伟  卜东波  刘金刚
作者单位:1. 首都师范大学计算机科学联合研究院,北京100048;中国科学院计算技术研究所计算生物研究组,北京100190
2. 中国科学院计算技术研究所计算生物研究组,北京,100190
3. 首都师范大学计算机科学联合研究院,北京,100048
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30800189);北京市自然科学基金资助项目(5102029)
摘    要:介绍蛋白质质谱鉴定领域的串联质谱谱库搜索技术,分析谱库搜索技术的基本原理,从多个角度阐述当前主流的谱库搜索方法,并对其优缺点进行比较,针对目前蛋白质质谱鉴定技术所存在的优缺点,设计其改进思路,论述目前谱库搜索技术所面临的问题以及未来的研究趋势。

关 键 词:蛋白质鉴定  串联质谱  谱库搜索  质谱鉴定
收稿时间:2011-08-17

Survey on Spectrum Library Search Identification Technology for Tandem Mass Spectra
WANG Yao-jun , SUN Shi-wei , BU Dong-bo , LIU Jin-gang.Survey on Spectrum Library Search Identification Technology for Tandem Mass Spectra[J].Computer Engineering,2012,38(7):269-272.
Authors:WANG Yao-jun  SUN Shi-wei  BU Dong-bo  LIU Jin-gang
Affiliation:1(1.Join Faculty of Computer Scientific Research,Capital Normal University,Beijing 100048,China;2.Bioinformatics Group,Institute of Computing Technology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100190,China)
Abstract:The emerging approach of tandem mass spectra spectrum library searching in peptide identifications field is introduced.The basic principles of spectrum library building and searching are discussed.The review summarizes populate methods of spectrum library searching from different views,describes its advantages and limitations and provides a primer for researchers with interests in adopting this new approach for data analysis.The future outlook on the evolution and utility of spectrum libraries is also discussed and some optional cut-in points for study are supposed.
Keywords:protein identification  tandem mass spectra  spectrum library search  mass spectrometry
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