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一种基于编码等价变换和遗传算法的DNA序列优化设计
作者单位:
;1.大连大学先进设计与智能计算省部共建教育部重点实验室
摘 要:
针对DNA计算中的DNA序列设计问题,基于6个DNA序列设计约束条件,将DNA序列设计问题转化为多目标优化问题,提出小生境遗传算法进行求解。算法利用DNA序列设计中的相似性约束与H-测度约束,在单链DNA序列集合上定义共享函数,利用两种类型的编码等价变换以及模4算术运算,构造了5个遗传算子,并给出具体的DNA序列设计结果。通过比较,算法可以得到质量更好的DNA序列,且在种群规模与进化代数方面具有更高的计算效率。
关 键 词:
DNA计算
DNA序列设计
DNA编码
小种群遗传算法
线性码
A DNA SEQUENCE OPTIMISATION DESIGN BASED ON CODE EQUIVALENT TRANSFORMATION AND GENETIC ALGORITHM
Abstract:
Keywords:
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