| 改进的牵引移动的蚁群算法在2D HP模型中的应用 |
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| 引用本文： | 高翔,杨惠,张成文.改进的牵引移动的蚁群算法在2D HP模型中的应用[J].计算机应用与软件,2015(3):275-278. |
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| 作者姓名： | 高翔 杨惠 张成文 |
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| 作者单位： | 兰州文理学院电子信息工程学院 甘肃 兰州 730000 |
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| 基金项目： | 甘肃省教育厅研究生导师项目(1215_04) |
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| 摘 要： | 蛋白质折叠问题就是从氨基酸序列中预测蛋白质的构象,该问题是生物信息学的一个突出问题。主要研究二维HP格点模型,它是用于模拟蛋白质折叠问题的一个具有代表性的简化模型,并且将蚁群算法用于求解该二维HP蛋白质的折叠问题。此外,在局部搜索机制中引入一种改进的牵引移动方法,这是一个提高蛋白质构象的有效方法。实验结果表明,针对较长的氨基酸序列,改进的带牵引移动的蚁群算法(ACO+)比ACO能够获得更低能量的构象,证明了所提出的改进蚁群算法是预测蛋白质结构的有效方法。
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| 关 键 词： | 蛋白质折叠 HP模型 牵引移动 蚁群优化 |
APPLYING IMPROVED PULL MOVES ACO IN 2D HP MODEL |
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| Gao Xiang
,
Yang Hui
,
Zhang Chengwen.APPLYING IMPROVED PULL MOVES ACO IN 2D HP MODEL[J].Computer Applications and Software,2015(3):275-278. |
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| Authors: | Gao Xiang Yang Hui Zhang Chengwen |
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| Affiliation: | Gao Xiang;Yang Hui;Zhang Chengwen;School of Electronics and Information Engineering,Lanzhou University of Arts and Science; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Protein folding HP model Pull moves Ant colony optimisation |
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