人类蛋白编码基因外显子谱和同义密码子偏好的研究 |
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引用本文: | 杨潇,胡军,陈祥贵.人类蛋白编码基因外显子谱和同义密码子偏好的研究[J].西华大学学报(自然科学版),2008,27(2):79-82. |
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作者姓名: | 杨潇 胡军 陈祥贵 |
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作者单位: | 西华大学生物工程学院,四川,成都,610039 |
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基金项目: | 四川省应用基础研究计划 |
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摘 要: | 从UCSC数据库提取基因序列,通过codon W软件进行密码子偏好性分析.比较分析不同外显子谱的人类蛋白编码基因密码子使用偏好,发现在多外显子基因中,随着基因外显子数增加,NNu和NNA型密码子RSCU值上升,NNC型密码子RSCU值下降,UUG密码子RSCU值增加,而其它NNG型密码子RSCU值下降.作为具有最少外显子数的基因,单外显子基因密码子RSCU值具有异常的表现,表明其具有和多外显子基因不同的起源和进化过程.
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关 键 词: | 人类蛋白编码基因 密码子偏好.外显子谱 |
文章编号: | 1673-159X(2008)02-0079-82 |
修稿时间: | 2007年7月11日 |
Study on the Relationship Between Exonic Pattern and Codon Bias of Human Protein-coding Gene |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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