| 基于最小自由能的DNA编码设计算法 |
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| 引用本文： | 张凯,肖建华,耿修堂,强小利.基于最小自由能的DNA编码设计算法[J].武汉理工大学学报(信息与管理工程版),2008,30(2):176-179. |
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| 作者姓名： | 张凯 肖建华 耿修堂 强小利 |
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| 作者单位： | 华中科技大学,控制科学与工程系,湖北,武汉,430074 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金
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国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 为了提高DNA计算的有效性和可靠性,提出了一种启发式的全局搜索DNA编码算法.算法生成一组等长的DNA序列,这组DNA序列满足统一的解链温度约束和最小自由能约束.通过枚举所有可能的DNA杂交的二级结构,根据Nearest-Neighbors热力学模型计算出这些组合结构的最小自由能,可极大地提高DNA序列自由能的计算精度.该算法比传统基于汉明距离的DNA编码算法设计的DNA序列具有更好的稳定性和可靠性.
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| 关 键 词： | DNA计算 最小自由能 DNA二级结构 DNA编码设计 最小自由能 编码算法 设计算法 Free Energy Minimal Based Algorithm Design 稳定性 算法设计 汉明距离 计算精度 组合结构 热力学模型 二级结构 杂交 度约束 统一 序列 搜索 |
| 文章编号： | 1007-144X(2008)02-0176-04 |
| 修稿时间： | 2007年11月21 |
DNA Sequences Design Algorithm Based on Minimal Free Energy |
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| ZHANG Kai,XIAO Jianhua,GENG Xiutang,QIANG Xiaoli.DNA Sequences Design Algorithm Based on Minimal Free Energy[J].Journal of Wuhan University of Technology(Information & Management Engineering),2008,30(2):176-179. |
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| Authors: | ZHANG Kai XIAO Jianhua GENG Xiutang QIANG Xiaoli |
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