| 10种海参16SrDNA 序列多样性及其亲缘关系分析 |
| |
| 引用本文： | 费来华,李赟,陈家鑫.10种海参16SrDNA 序列多样性及其亲缘关系分析[J].中国水产科学,2008,15(5). |
| |
| 作者姓名： | 费来华 李赟 陈家鑫 |
| |
| 作者单位： | 1. 中国海洋大学,山东,青岛,266003
2. 中国水产科学研究院,黄海水产研究所,山东,青岛,266071 |
| |
| 基金项目： | 中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室开放课题 |
| |
| 摘 要： | 运用PCR扩增10种海参的16SrDNA部分序列,并测序.获得大小为566bp的序列,利用DNAsp4.0软件分析比较10种海参的碱基组成、各碱基变异位点数、插入或缺失位点数,并采用MEGA4.0软件分析彼此间的遗传距离.结果发现,10种海参富含AT碱基,A T的含量平均为57.0%,不同种海参间发生碱基转换、颠换及发生插入或缺失变异的位点数差异很大,10种海参彼此间的遗传距离在0.007～0.316之间.所得结果与GenBank中10种海参的相应序列进行比对分析,同时用MEGA4.0和PAUP4.0软件构建进化树,分析其亲缘关系.结果表明,利用16SrDNA序列的差异可以将分属于海参科(Holothuriidae)与刺参科(Stichopodidae)的海参完全分开,瓜参科(Cucumariidae)的2个种与刺参科的亲缘关系较近.对不同海参种间亲缘关系的分析结果还表明,同属于剌参科的仿刺参(Apostichopus japonicus)与加州拟刺参(Parastichopus californicus)和具疣拟刺参(Parastichopus parvimensis)亲缘关系最近,同属于海参科的格皮氏海参(Pearsonothuria graeffei)与白尼参属的蛇目白尼参(Bohadschia argus)和图纹白尼参(B.marmorata)亲缘关系最近,而同样为海参科的墨西哥海参(Holothuria mexicana)则与红腹海参(Hothuria edulis)关系最近.这些资料为海参的种质资源管理、新种引进和种质改良提供了基础的分子生物学依据.
|
| 关 键 词： | 海参 系统发生 |
| 修稿时间： | 2010/4/8 0:00:00 |
16S rDNA sequence diversity and phylogenetic relationship of ten sea cucumbers |
| |
| FEI Lai-hua,LI Yun,CHEN Jia-xin.16S rDNA sequence diversity and phylogenetic relationship of ten sea cucumbers[J].Journal of Fishery Sciences of China,2008,15(5). |
| |
| Authors: | FEI Lai-hua LI Yun CHEN Jia-xin |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | 16SrDNA |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中国水产科学》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《中国水产科学》下载全文 |
|
