梨Trihelix转录因子家族成员鉴定及表达分析 |
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引用本文: | 韩文龙,朱振,李君茹,陈天哲,李国辉,苏雪强,金青,程曦,蔡永萍.梨Trihelix转录因子家族成员鉴定及表达分析[J].园艺学报,2021(3):439-455. |
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作者姓名: | 韩文龙 朱振 李君茹 陈天哲 李国辉 苏雪强 金青 程曦 蔡永萍 |
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作者单位: | 安徽农业大学生命科学学院;地方特色植物资源开发与利用安徽省工程技术中心 |
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基金项目: | 安徽省自然科学基金项目(2008085QC100);安徽农业大学青年基金项目(2019zd01);安徽农业大学稳定和引进人才项目(yj2019-17);安徽省级大学生创新基金项目(201910364156)。 |
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摘 要: | Trihelix转录因子可以和光应答相关的GT元件结合,因此又称GT转录因子。本研究从梨基因组中鉴定出16个Trihelix家族基因,依次命名为PbGT1~PbGT16,从同属于蔷薇科的草莓和桃基因组中分别鉴定出11和16个Trihelix家族基因。染色体定位与基因复制事件分析表明,梨、草莓和桃Trihelix家族成员分别分布在12、6和8条染色体上,且梨Trihelix家族存在片段复制事件。种间系统进化树分析表明,梨、草莓和桃Trihelix家族成员分为6个亚族,梨家族成员(PbGT)属于GT-2、Subfamily O和SIP1亚族。结合进化关系及qRT-PCR验证,筛选出PbGT15可能参与调控梨果实石细胞团木质化。
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关 键 词: | 梨 Trihelix转录因子 比较基因组学 表达分析 木质化 |
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