| 胡萝卜YUCCA基因家族鉴定及生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 闫学敏,吴英华,史艳,武喆,侯雷平,李梅兰.胡萝卜YUCCA基因家族鉴定及生物信息学分析[J].江苏农业科学,2021,49(23):52-57. |
| |
| 作者姓名： | 闫学敏 吴英华 史艳 武喆 侯雷平 李梅兰 |
| |
| 作者单位： | 山西农业大学园艺学院,山西太谷030801 |
| |
| 摘 要： | 胡萝卜是重要的根菜类蔬菜之一,根部性状影响最终的产量和品质.YUCCA基因通过介导生长素调控植物根部发育,是生长素合成途径中的关键基因.利用生物信息学方法对胡萝卜YUCCA基因家族成员进行鉴定,对其理化性质、染色体定位、系统进化树、蛋白质的二级和三级结构以及保守基序进行分析.结果表明,在胡萝卜的5条染色体上共鉴定到了14个YUCCA基因家族成员,其大部分基因含有3～4个外显子;该家族编码的蛋白质为富含碱性氨基酸的亲水性蛋白质,氨基酸数量为290～424个,其蛋白质结构主要以α-螺旋和无规则卷曲构成,通过构建系统进化树可将其分为3个亚族,且亚细胞定位结果显示,YUCCA基因家族蛋白质大部分被定位在细胞质中.这为YUCCA基因家族在调控胡萝卜根发育和膨大机制研究奠定了理论基础.
|
| 关 键 词： | 胡萝卜 生长素 YUCCA基因家族 生物信息学 蛋白质结构 染色体定位 |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
