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云南独龙鸡和红原鸡卵巢组织转录组水平的比较分析
引用本文:丁玥竹,任宇,扈孟雪,燕文荃,郭爱伟,周杰珑,吴培福,陈粉粉,刘莉莉.云南独龙鸡和红原鸡卵巢组织转录组水平的比较分析[J].江苏农业科学,2023(5):38-44.
作者姓名:丁玥竹  任宇  扈孟雪  燕文荃  郭爱伟  周杰珑  吴培福  陈粉粉  刘莉莉
作者单位:西南林业大学生命科学学院
基金项目:国家自然科学基金(编号:31902152);;云南省教育厅科学研究基金项目(研究生类)(编号:2021Y267);;云南省科技厅基础研究项目(编号:2019FD06);
摘    要:为明确独龙鸡的基因功能和种质特性,试验采集3羽健康状况良好的独龙鸡卵巢组织进行转录组测序,并与饲养条件基本相似并且同周龄的红原鸡卵巢组织进行比较。结果表明,与红原鸡相比,独龙鸡中差异表达基因共有7 404个。KEGG和GO富集分析表明,差异表达基因主要富集在GTP酶激活剂活性、膜结构、泛素蛋白连接酶活性和ATP结合等过程,并参与Ras信号通路、硒化合物的代谢通路、SNARE因子在囊泡运输中的相互作用等通路。对显著性通路分析发现,独龙鸡在蛋品质和免疫抗性上具有一定优势,但在产蛋性能上与红原鸡还存在一定差距。说明NCBP1、NCBP2、TXNRD1、PTEN、ENOX1基因主要富集在抗性、产蛋性能和蛋品质相关通路中,可进一步深入研究。

关 键 词:独龙鸡  红原鸡  卵巢组织  转录组测序  差异表达基因
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