巨(魾)细胞色素氧化酶基因多态性及系统进化研究 |
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引用本文: | 杜民,牛宝珍,王婷婷,艾加林,刘艳红.巨(魾)细胞色素氧化酶基因多态性及系统进化研究[J].上海水产大学学报,2016(3):337-343. |
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作者姓名: | 杜民 牛宝珍 王婷婷 艾加林 刘艳红 |
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作者单位: | 红河学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,云南蒙自 661199;红河学院生命科学与技术学院,云南蒙自661199 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31360638),云南省教育厅科学研究基金重大专项(ZD2013009),云南省中青年学术带头人后备人才项目(2015HB059),红河学院中青年学术带头人后备人才项目(2014HB0203),红河学院博士专项(14bs11) |
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摘 要: | 采用PCR技术克隆得到12尾巨(魾)(Bagarius yarrelli)的细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)、细胞色素氧化酶Ⅱ(COⅡ)和细胞色素氧化酶Ⅲ(COⅢ)的基因序列.结果显示:巨(魾)CO Ⅰ基因序列全长1 551 bp,12个个体共出现9个单倍型,13个突变位点;COⅡ基因序列全长691 bp,12个个体共出现5个单倍型,5个突变位点;COⅢ基因序列全长784 bp,12个个体出现7个单倍型,8个突变位点.通过最小进化法Minimum Evolution (ME)构建系统发育树分析显示,巨(魾)与14种鱿科鱼在序列上有一定的同源性,并且CO Ⅰ、COⅡ和COⅢ都与中华纹胸姚(Glyptothorax sinense)、福建纹胸鱿(Glyptothorax fukiensis)、三线纹胸鱿(Glyptothorax trilineatus)和长丝黑鱿(Gagata dolichonema)在同一个分支,表明巨(魾)与纹胸鱿属和黑跳属有较近的亲缘关系.
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关 键 词: | 巨(魾) CO Ⅰ CO Ⅱ CO Ⅲ 序列分析 系统发育 |
Study on the polymorphism and phylogeny of cytochrome oxidase gene of Bagarius yarrelli |
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Abstract: | |
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Keywords: | Bagarius yarrelli Cytochrome oxidase subunit Ⅰ (CO Ⅰ) Cytochrome oxidase subunit Ⅱ (CO Ⅱ) Cytochrome oxidase subunit Ⅲ (CO Ⅲ) sequence analysis phylogeny |
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