首页 | 官方网站   微博 | 高级检索  
     

基于转录组序列的青榨槭EST-SSR标记开发及通用性分析
引用本文:穆莹,白云海,吴静,窦德泉,张睿鹂.基于转录组序列的青榨槭EST-SSR标记开发及通用性分析[J].分子植物育种,2024(8):2590-2599.
作者姓名:穆莹  白云海  吴静  窦德泉  张睿鹂
作者单位:1. 北京农学院园林学院;2. 北京农学院,城乡生态环境北京实验室
基金项目:北京市教委科技计划项目(KM202010020005)资助;
摘    要:青榨槭为目前重要的秋季彩叶园林绿化优良树种之一。本研究基于青榨槭叶片转录组数据进行了SSR标记分析,结果发现其中3 744条unigene序列中含有3 763个SSR位点,发生频率为6.93%,每11.89 kb含一个位点。优势重复序列类型为二核苷酸重复和三核苷酸,分别占总SSR位点的51.21%与46.93%;AG/CT与GAA/TTC分别是二核苷酸和三核苷酸的优势重复基元。654对引物中252对(38.53%)引物可成功扩增出目的条带,75对(11.47%)引物表现出多态性。75对多态性引物在槭属16个种质间转移率范围为83.75%~100%,平均转移率为90.08%,表明这75对标记具有较高的通用性。利用转录组开发青榨槭SSR标记可为青榨槭以及槭属种质资源研究、分子标记辅助育种等提供重要的遗传资源。

关 键 词:青榨槭  转录组  SSR标记  通用性
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司    京ICP备09084417号-23

京公网安备 11010802026262号