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基于转录组测序初步筛选维生素C延缓秀丽隐杆线虫衰老的相关基因
引用本文:王少营,王少聪,李培峰,曾焕玉.基于转录组测序初步筛选维生素C延缓秀丽隐杆线虫衰老的相关基因[J].青岛大学学报(自然科学版),2023(3):27-33.
作者姓名:王少营  王少聪  李培峰  曾焕玉
作者单位:青岛大学转化医学研究院
基金项目:国家自然科学基金外国青年学者研究基金(批准号:82050410450)资助;
摘    要:为探究维生素C调控秀丽隐杆线虫寿命通路相关基因,设置空白对照组(0 mg/mL维生素C组)、0.4 mg/mL维生素C组、0.8 mg/mL维生素C组以及1.6 mg/mL维生素C组,构建维生素C处理秀丽隐杆线虫模型,检测维生素C与秀丽隐杆线虫寿命关系。空白对照组和处理组利用Illumina HiSeq基因转录组测序。通过本位数据库(Gene Ontology, GO)和通路显著性富集分析数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)挖掘影响秀丽隐杆线虫寿命的差异表达基因。研究发现,0.8 mg/mL维生素C处理下,秀丽隐杆线虫寿命相较于其他浓度明显延长,lips-10基因表达明显上调且参与秀丽隐杆线虫寿命相关通路调节过程,表明维生素C能够影响秀丽隐杆线虫寿命,调控其相关衰老过程。

关 键 词:秀丽隐杆线虫  维生素C  氧化衰老  转录组测序
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