基于转录组测序初步筛选维生素C延缓秀丽隐杆线虫衰老的相关基因 |
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引用本文: | 王少营,王少聪,李培峰,曾焕玉.基于转录组测序初步筛选维生素C延缓秀丽隐杆线虫衰老的相关基因[J].青岛大学学报(自然科学版),2023(3):27-33. |
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作者姓名: | 王少营 王少聪 李培峰 曾焕玉 |
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作者单位: | 青岛大学转化医学研究院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金外国青年学者研究基金(批准号:82050410450)资助; |
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摘 要: | 为探究维生素C调控秀丽隐杆线虫寿命通路相关基因,设置空白对照组(0 mg/mL维生素C组)、0.4 mg/mL维生素C组、0.8 mg/mL维生素C组以及1.6 mg/mL维生素C组,构建维生素C处理秀丽隐杆线虫模型,检测维生素C与秀丽隐杆线虫寿命关系。空白对照组和处理组利用Illumina HiSeq基因转录组测序。通过本位数据库(Gene Ontology, GO)和通路显著性富集分析数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)挖掘影响秀丽隐杆线虫寿命的差异表达基因。研究发现,0.8 mg/mL维生素C处理下,秀丽隐杆线虫寿命相较于其他浓度明显延长,lips-10基因表达明显上调且参与秀丽隐杆线虫寿命相关通路调节过程,表明维生素C能够影响秀丽隐杆线虫寿命,调控其相关衰老过程。
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关 键 词: | 秀丽隐杆线虫 维生素C 氧化衰老 转录组测序 |
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