| 降维近似支持向量机基因芯片数据分类器 |
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| 引用本文： | 王立鹏,袁占亭,周智芳.降维近似支持向量机基因芯片数据分类器[J].重庆大学学报(自然科学版),2011,34(12):102-108. |
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| 作者姓名： | 王立鹏 袁占亭 周智芳 |
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| 作者单位： | 兰州理工大学 电气工程与信息工程学院,甘肃 兰州 730050;兰州理工大学 电气工程与信息工程学院,甘肃 兰州 730050;兰州理工大学 石油化工学院,甘肃 兰州 730050 |
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| 基金项目： | 国家十一五科技支撑资助项目(2006BAF01A21);甘肃自然科学基金资助项目(3ZS062-B25-037) |
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| 摘 要： | 基因芯片技术的出现改变了生物医学研究的前景,其产生的海量数据是限制其发展的瓶颈问题。论文针对基因芯片数据量大、样本数低和基因维数高的特点,提出了一种对基因芯片数据进行分类的降维近似支持向量机DRPSVM基因芯片数据分类器。DRPSVM采用降维的二次规划算法,使得该算法的时间复杂度和空间复杂度比传统的PSVM算法均有降低。通过在CAMDA2000、colon 1 dataset和colon 2 dataset等基因芯片数据集上的与BP、Nearest、RBF、SVM分类器的分类性能比较,DRPSVM在数据样本少、数据维数急剧升高时,分类性能稳定、存在唯一的最优解、训练时间快,适合基因芯片数据分类的应用环境。
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| 关 键 词： | 生物信息学 基因芯片数据 近似支持向量机 降维 分类器 二次规划 |
Microarray data classifier with dimensionality reductionproximal support vector machines |
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| WANG Li peng,YUAN Zhan ting and ZHOU Zhi fang.Microarray data classifier with dimensionality reductionproximal support vector machines[J].Journal of Chongqing University(Natural Science Edition),2011,34(12):102-108. |
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| Authors: | WANG Li peng YUAN Zhan ting and ZHOU Zhi fang |
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| Affiliation: | College of Electrical and Information Engineering, Lanzhou 730050, Gansu, P.R. China;College of Electrical and Information Engineering, Lanzhou 730050, Gansu, P.R. China;College of Petrochemical Technology, Lanzhou University of Technology, Lanzhou 730050, Gansu, P.R. China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bioinformatics microarray data proximal support vector machines dimensionality reduction classifier quadratic programming |
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