| 基于生物信息学方法的小鼠精子发生关键基因筛选 |
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| 引用本文： | 李欣,田佳,脱征军,邵怀峰,张伟新,李委奇,王琨,徐寒,温万.基于生物信息学方法的小鼠精子发生关键基因筛选[J].中国畜牧杂志,2021(2):84-89. |
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| 作者姓名： | 李欣 田佳 脱征军 邵怀峰 张伟新 李委奇 王琨 徐寒 温万 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所;宁夏畜牧工作站 |
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| 基金项目： | 优质高产奶牛选育(2019NYYZ05)。 |
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| 摘 要： | 为探索精子发生的分子机制,寻找精子变形期间的关键基因,本研究从公共基因表达数据库下载小鼠精细胞的转录组测序数据,利用R软件Ballgown程序包筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行Gene ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析后,再对筛选出的关键基因进行分析。结果显示:筛选出8个相关性较强的关键通路,将其所包含的基因进行FPKM值从大到小排序,取前18名的基因进行功能分析。其中,Txnrd3和Tcp1与繁殖活动相关;Gpx4、Dkkl1、Dbil5与发育相关;Prm2、Selenof、Tnp1、Tnp2、Ropn1l、Pafah1b2、Spink2和Prm1等8个基因参与精子发生;Spa17、Ldhc、Hsp90aa1、Gstm5和Csnk2b参与鞭毛和纤毛的形成。以上基因对精子发生具有重要作用,深入发掘这些基因的功能特点可为进一步揭示精子变形机制提供理论依据。
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| 关 键 词： | 精子发生 生物信息学分析 差异基因 |
Screening of Key Genes for Mouse Spermatogenesis Based on Bioinformatics Methods |
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| LI Xin,TIAN Jia,TUO Zhengjun,SHAO Huaifeng,ZHANG Weixin,LI Weiqi,WANG Kun,XU Han,WEN Wan.Screening of Key Genes for Mouse Spermatogenesis Based on Bioinformatics Methods[J].Chinese Journal of Animal Science,2021(2):84-89. |
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| Authors: | LI Xin TIAN Jia TUO Zhengjun SHAO Huaifeng ZHANG Weixin LI Weiqi WANG Kun XU Han WEN Wan |
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| Affiliation: | (Institute of Animal Sciences of CAAS,Beijing 100193,China;Ningxia Animal Husbandry Work Station,Ningxia Yinchuan 750105,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Spermatogenesis Bioinformatics analysis Differential genes |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
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