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角毛壳菌降解粗纤维基因的筛选
引用本文:张海燕,杨谦.角毛壳菌降解粗纤维基因的筛选[J].林产化学与工业,2007,27(3):21-26.
作者姓名:张海燕  杨谦
作者单位:哈尔滨工业大学,生命科学与工程系,黑龙江,哈尔滨,150001
基金项目:国家863高技术项目资助(2003AA241140)
摘    要:以角毛壳菌菌丝体为材料,构建cDNA文库并进行了部分表达序列标签(ESTs)的分析。文库的滴度为1.02×106pfu/mL,重组率为95.3%,插入片段平均长度大于1.2kb。在cDNA文库中随机选择克隆从5′端测序得到1219个高质量ESTs,拼接为804条独立基因。其中460条(57.2%)与NCBI中非冗余蛋白质库(NR)已知基因有不同程度同源性的代表已知功能基因,344(42.8%)条独立基因与NR库中基因没有显著同源性的代表未知功能新基因。从已知基因中鉴定出了降解粗纤维的基因:β-1,4-内切葡聚糖酶基因、β-葡萄糖苷酶基因、β-内切木聚糖酶基因、木糖苷酶基因、漆酶基因。

关 键 词:角毛壳菌菌丝体  cDNA文库  表达序列标签  生物信息学分析  降解粗纤维基因
文章编号:0253-2417(2007)03-0021-06
修稿时间:2006-03-24

Construction of Chaetomium cupreum Mycelia cDNA Library and Screening of Genes for Decomposing Crude Fiber
ZHANG Hai-yan,YANG Qian.Construction of Chaetomium cupreum Mycelia cDNA Library and Screening of Genes for Decomposing Crude Fiber[J].Chemistry & Industry of Forest Products,2007,27(3):21-26.
Authors:ZHANG Hai-yan  YANG Qian
Affiliation:Department of Life Science and Technology, Harbin Institute of Technology, Harbin 150001, China
Abstract:
Keywords:mycelia of Chaetomium cupreum  cDNA library  ESTs  bioinformatics analysis  genes for decomposing crude fiber
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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