| 肿瘤转移抑制基因HTPAP的Haploview单体型构建分析 |
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| 引用本文： | 武金才,任宁,李国才,孙冰生,刘道永,史炯,戴春,董琼珠,孙海晶,叶青海,钦伦秀.肿瘤转移抑制基因HTPAP的Haploview单体型构建分析[J].中华实验外科杂志,2008,25(2). |
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| 作者姓名： | 武金才 任宁 李国才 孙冰生 刘道永 史炯 戴春 董琼珠 孙海晶 叶青海 钦伦秀 |
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| 作者单位： | 复旦大学肝癌研究所,复旦大学附属中山医院,上海,200032 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，国家自然科学基金，国家自然科学基金，上海市自然科学基金 |
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| 摘 要： | 目的 通过单核苷酸多态性(SNP)检测对肿瘤转移抑制基因HTPAP进行单体型构建和分析.方法 取100例肝细胞癌(HCC)新鲜标本,应用激光捕获组织显微切割获取纯肝癌细胞、提取DNA,对HTPAP基因上已登录的15个SNP位点进行检测,应用Haploview软件构建单体型.结果 15个SNP位点中,有8个表现为单态、5个呈多态性、2个未能检测出.对100例肝细胞癌的该5个多态位点进行单体型构建后发现11种单体型,其中3种单体型(C-A-T-C-A、C-G-T-C-A和T-A-G-G-G)最常见,占87%,另外8种单体型占13%.4个SNP(rs7007097、rs3830326、rs1149、rs3739252)表现为强连锁不平衡关系,尽管rs11539529出现重组现象,但从整体看还是属于同一个单体型块.结论 肿瘤转移抑制基因HTPAP在肝癌中常见C-A-T-C-A、C-G-T-C-A和T-A-G-G-G三种单体型,针对不同单体型研究分析可能为肝癌转移复发、预后预测提供新的途径和指标.
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| 关 键 词： | 癌 肝细胞 单核苷酸多态性 转移 基因 |
Construction of the haplotype for tumor metastasis suppressor HTPAP by Haploview software |
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