| 人参质体ATP/ADP转运蛋白基因PgAATP1的克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 陈静,李纯,肖逸凡,孙春玉,王艳芳,王康宇,赵明珠,王义,张美萍.人参质体ATP/ADP转运蛋白基因PgAATP1的克隆及表达分析[J].中草药,2019,50(18):4411-4418. |
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| 作者姓名： | 陈静 李纯 肖逸凡 孙春玉 王艳芳 王康宇 赵明珠 王义 张美萍 |
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| 作者单位： | 吉林农业大学 人参基因资源工程研究中心, 吉林 长春 130118;吉林农业大学生命科学学院, 吉林 长春 130118,吉林农业大学 人参基因资源工程研究中心, 吉林 长春 130118;吉林农业大学生命科学学院, 吉林 长春 130118,吉林农业大学生命科学学院, 吉林 长春 130118,吉林农业大学 人参基因资源工程研究中心, 吉林 长春 130118;吉林农业大学生命科学学院, 吉林 长春 130118,吉林农业大学 人参基因资源工程研究中心, 吉林 长春 130118;吉林农业大学中药材学院, 吉林 长春 130118,吉林农业大学 人参基因资源工程研究中心, 吉林 长春 130118;吉林农业大学生命科学学院, 吉林 长春 130118,吉林农业大学 人参基因资源工程研究中心, 吉林 长春 130118;吉林农业大学生命科学学院, 吉林 长春 130118,吉林农业大学 人参基因资源工程研究中心, 吉林 长春 130118;吉林农业大学生命科学学院, 吉林 长春 130118,吉林农业大学 人参基因资源工程研究中心, 吉林 长春 130118;吉林农业大学生命科学学院, 吉林 长春 130118 |
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| 基金项目： | 国家"863"计划项目（2013AA102604）;吉林省发改委-吉林省农产业创新专项资金项目（2016C04）;吉林省科技厅自然科学基金项目（20180101027JC）;吉林省科技厅自然科学基金项目（20190201264JC） |
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| 摘 要： | 目的克隆人参Panax ginseng中质体ATP/ADP转运蛋白基因(ATP/ADP transporter protein,AATP),为深入研究其在人参中的生物学功能奠定基础。方法利用人参14个组织部位转录组测序的转录组数据库,通过与NCBI下载的其他植物中AATP的m RNA序列进行本地Blast比对,从中筛选出质体ATP/ADP转运蛋白基因。利用PCR技术克隆获得该基因的全长,通过生物信息学软件分析该基因编码蛋白的信息。利用人参14个组织部位的转录组数据库分析该基因在人参不同组织中的表达模式,并利用实时荧光定量PCR检测茉莉酸甲酯处理条件下该基因的表达模式。结果获得人参AATP1基因全长c DNA,命名为Pg AATP1,该基因长度为1 866 bp,编码621个氨基酸,蛋白质相对分子质量为67 897.23,等电点为9.58。该蛋白与其他物种中的质体ATP/ADP转运蛋白比较类似,分析发现Pg AATP1在人参中所有组织中表达量均比较高,在果肉和叶片中表达量最高。实时荧光定量PCR检测发现Pg AATP1基因在茉莉酸甲酯处理条件下表达持续上调。结论获得Pg AATP1基因全长cDNA序列,该基因在淀粉合成旺盛的组织中表达量较高,且响应茉莉酸甲酯处理。
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| 关 键 词： | 人参 质体ATP/ADP转运蛋白 生物信息学 表达分析 茉莉酸甲酯 |
| 收稿时间： | 2019/4/3 0:00:00 |
Cloning and expression analysis of ATP/ADP transporter protein gene PgAATP1 in Panax ginseng |
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| CHEN Jing,LI Chun,Xiao Yi-fan,SUN Chun-yu,WANG Yan-fang,WANG Kang-yu,ZHAO Ming-zhu,WANG Yi and ZHANG Mei-ping.Cloning and expression analysis of ATP/ADP transporter protein gene PgAATP1 in Panax ginseng[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2019,50(18):4411-4418. |
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| Authors: | CHEN Jing LI Chun Xiao Yi-fan SUN Chun-yu WANG Yan-fang WANG Kang-yu ZHAO Ming-zhu WANG Yi and ZHANG Mei-ping |
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| Affiliation: | Research Center for Ginseng Genetic Resources, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;College of Life Science, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,Research Center for Ginseng Genetic Resources, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;College of Life Science, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,College of Life Science, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,Research Center for Ginseng Genetic Resources, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;College of Life Science, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,Research Center for Ginseng Genetic Resources, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;College of Chinese Medicinal Materials, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,Research Center for Ginseng Genetic Resources, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;College of Life Science, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,Research Center for Ginseng Genetic Resources, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;College of Life Science, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China,Research Center for Ginseng Genetic Resources, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;College of Life Science, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China and Research Center for Ginseng Genetic Resources, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;College of Life Science, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Panax ginseng C A Meyer ATP/ADP transporter protein bioinformatics expression profile analysis methyl jasmonate |
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