| 铁皮石斛F-box蛋白基因DoSKP2A的克隆与表达分析 |
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| 引用本文： | 李欢,黑小斌,李依民,杨琳,刘清,颜永刚,胡本祥,张岗.铁皮石斛F-box蛋白基因DoSKP2A的克隆与表达分析[J].中草药,2019,50(8):1960-1965. |
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| 作者姓名： | 李欢 黑小斌 李依民 杨琳 刘清 颜永刚 胡本祥 张岗 |
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| 作者单位： | 陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心, 陕西 西安 712046 |
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| 基金项目： | 陕西中医药大学“秦药”品质评价及资源开发创新团队项目；公益性行业（中医药）科研专项经费项目（201507002-1-08）；陕西中医药大学新进博士科研启动经费（104080001）；陕西省高校青年杰出人才支持计划项目；咸阳市中青年科技领军人才项目 |
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| 摘 要： | 目的克隆珍稀濒危兰科药用铁皮石斛F-box蛋白基因即S期激酶相关蛋白(S phase kinase-associated protein)基因DoSKP2A,并进行生物信息学和表达特征分析。方法采用RACE技术获基因全长;利用生物信息软件预测基因编码蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 7.0和MEGA 7.0分别进行氨基酸多序列比对和进化树构建;借助定量PCR检测基因表达模式。结果克隆到DoSKP2A(GenBank注册号KU160472),c DNA全长1 507 bp,开放阅读框(ORF)长1 101 bp,编码蛋白含366个氨基酸,相对分子质量39 590,等电点7.9。DoSKP2A蛋白不含跨膜域和信号肽,包含F-box核心结构域(26～88)、亮氨酸重复序列LRR(202～226)和多个保守基序;Do SKP2A与植物SKP2As蛋白一致性为64.6%～72.4%,所在分支隶属于SKP2As分子进化的单子叶植物分支,与小兰屿蝴蝶兰SKP2A亲缘关系近;DoSKP2A基因转录本在石斛3种器官中为组成型表达,根中相对表达量较高,为叶中的6.16倍,茎中次之,叶中表达量很低。结论获得一个全新的铁皮石斛F-box蛋白基因DoSKP2A全长、生物信息及其表达特征,为研究其在铁皮石斛生长发育、信号传导和抗逆境胁迫的分子机制提供基础。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 SKP2A蛋白 基因克隆 序列分析 实时荧光定量PCR |
| 收稿时间： | 2018/11/12 0:00:00 |
Cloning and expression analysis of an F-box protein gene DoSKP2A in Dendrobium officinale |
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| LI Huan,HEI Xiao-bin,LI Yi-min,YANG Lin,LIU Qing,YAN Yong-gang,HU Ben-xiang and ZHANG Gang.Cloning and expression analysis of an F-box protein gene DoSKP2A in Dendrobium officinale[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2019,50(8):1960-1965. |
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| Authors: | LI Huan HEI Xiao-bin LI Yi-min YANG Lin LIU Qing YAN Yong-gang HU Ben-xiang and ZHANG Gang |
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| Affiliation: | Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China and Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale Kimura et Migo SKP2A gene cloning sequence analysis qRT-PCR |
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