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分子模拟研究蛋白质β-折叠区结合随机 RNA 片段
引用本文:王明华,李杜娟.分子模拟研究蛋白质β-折叠区结合随机 RNA 片段[J].广州化工,2015(15).
作者姓名:王明华  李杜娟
作者单位:1. 忻州师范学院生物系,山西忻州,034000
2. 杭州电子科技大学生命信息与仪器工程学院,浙江杭州,310018
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31201367);忻州师范学院青年基金项目(201208);浙江省公益性技术应用研究计划项目(2014C33002)。
摘    要:选取来源于大肠杆菌O157: H7全基因组DNA序列随机转录的3条RNA片段,通过RNAComposer进行结构预测,30个核苷酸的RNA片段均形成了特定的空间结构,构象与碱基排列的序列特异性有关。 NPDock可用于RNA-蛋白质相互作用的分子模拟预测,蛋白质的β-结构相对α-螺旋更容易裸露出特定氨基残基的特异性侧链基团,从而易于结合抗原等配体。

关 键 词:RNA结构预测  NPDock  β-折叠蛋白质  相互作用

Molecular Modeling the β-sheet Protein Interacting with the Random RNA Fragment
WANG Ming-hua,LI Du-juan.Molecular Modeling the β-sheet Protein Interacting with the Random RNA Fragment[J].GuangZhou Chemical Industry and Technology,2015(15).
Authors:WANG Ming-hua  LI Du-juan
Abstract:
Keywords:RNA structure prediction  NPDock  β-sheet Protein  interaction
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