云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS基因进化分析 |
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引用本文: | 肖雪,张文东,段博芳,赵焕云,刘庆亮,胡挺松,邱薇,冯子良,郑颖,范泉水,张应国,张富强.云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS基因进化分析[J].中华流行病学杂志,2013,34(5):491-495. |
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作者姓名: | 肖雪 张文东 段博芳 赵焕云 刘庆亮 胡挺松 邱薇 冯子良 郑颖 范泉水 张应国 张富强 |
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作者单位: | 云南农业大学, 昆明, 50223;云南省动物疫病预防控制中心;云南省动物疫病预防控制中心;云南省动物疫病预防控制中心;云南省动物疫病预防控制中心;云南省动物疫病预防控制中心;成都军区疾病预防控制中心;成都军区疾病预防控制中心;成都军区疾病预防控制中心;成都军区疾病预防控制中心;成都军区疾病预防控制中心;云南省动物疫病预防控制中心;1. 云南农业大学, 昆明, 50223;2. 云南省动物疫病预防控制中心;3. 成都军区疾病预防控制中心 |
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基金项目: | 云南省科技计划(2012CH002);国家公益性行业科研专项(201103008) |
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摘 要: | 目的 阐明云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NSl、NS2基因变异特征及遗传进化关系。方法 在云南边境地区采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品,经H5N1亚型特异性多重RT-PCR检测,阳性样品对病毒NS基因进行扩增,克隆Z至pMDl8一T载体测序,获得NSl、NS2基因序列,并与已知参考毒株序列进行序列比对及系统发育分析。结果 自1240份样品中检出H5N]亚型阳性样品71份,阳性率为5.72%;30份代表性阳性样品病毒NS基因测序获得17种序列,存在3个不同进化(亚)分支(I一1、I一2、Ⅱ);NSl/NS2基因与病毒血凝素(HA)基因呈现不同进化关系;NSl蛋白涉及核定位信号区、RNA结合区、效应区及其他致病性相关的关键性氨基酸位点存在替代或突变。结论 云南边境地区H5N1亚型病毒NSl/NS2基因具有遗传差异,2010年以来NS基因进化分支I一2、Ⅱ已成为当地流行的优势毒株。
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关 键 词: | 禽流感病毒 H5N1亚型 非结构蛋白l 非结构蛋白2或核输出蛋白 遗传分析 |
收稿时间: | 2012/12/24 0:00:00 |
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