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青藏高原湖泊沉积物硫酸盐还原菌种群分布
引用本文:杨渐,蒋宏忱,孙永娟,吴耿,侯卫国,董海良,赖忠平.青藏高原湖泊沉积物硫酸盐还原菌种群分布[J].盐湖研究,2013,21(1):7-13.
作者姓名:杨渐  蒋宏忱  孙永娟  吴耿  侯卫国  董海良  赖忠平
作者单位:1. 中国科学院青海盐湖研究所,青海西宁810008;中国地质大学(武汉),生物地质与环境地质国家重点实验室,湖北武汉430074;中国科学院大学,北京100049
2. 中国地质大学(武汉),生物地质与环境地质国家重点实验室,湖北武汉430074
3. 中国科学院青海盐湖研究所,青海西宁,810008
4. 中国地质大学(北京),生物地质与环境地质国家重点实验室,北京100083
5. 中国地质大学(武汉),生物地质与环境地质国家重点实验室,湖北武汉430074;中国地质大学(北京),生物地质与环境地质国家重点实验室,北京100083
6. 中国科学院青海盐湖研究所,青海西宁810008;中国科学院寒区旱区环境与工程研究所,甘肃兰州730000
基金项目:国家自然科学基金青年科学基金项目(41002123);国家自然科学基金重点项目(41030211);国家自然科学基金创新群体项目(41121001)
摘    要:采用聚合酶链式反应(PCR,Polymerase Chain Reaction)、变性梯度凝胶电泳(DGGE,Denaturing Gra-dient Gel Electrophoresis)与实时荧光定量聚合酶链式反应(Q-PCR,Quantitative PCR)相结合的综合分析技术,研究了青藏高原洱海、青海湖、尕海1、尕海2、小柴旦湖沉积物硫酸盐还原菌多样性及丰度。研究结果显示,5个盐湖沉积物中dsrB(编码亚硫酸还原酶β亚基,为硫酸盐还原菌所共有)基因的丰度为每克沉积物1.71×108~1.55×109拷贝,与盐度无明显相关性;所获得的dsrB基因序列分属于3个科:Desulfobacter-aceae,Desulfobulbaceae和Peptococcaceae。其中,Desulfobacteraceae科是主要类群。硫酸盐还原菌多样性(DGGE结果)与盐度呈现出负相关性。故在所研究的盐湖中,盐度可能不是影响硫酸盐还原菌种群分布的唯一因素,可能还受其它未知环境因素的影响,有待于进一步研究。

关 键 词:dsrB基因  DGGE  硫酸盐还原菌  青藏高原湖泊

Abundance and Diversity of Sulfate-reducing Bacteria in Qinghai-Tibetan Lakes
YANG Jian,JIANG Hong-chen,SUN Yong-juan,WU Geng,HOU Wei-guo,DONG Hai-liang,LAI Zhong-ping.Abundance and Diversity of Sulfate-reducing Bacteria in Qinghai-Tibetan Lakes[J].Journal of Salt Lake Research,2013,21(1):7-13.
Authors:YANG Jian  JIANG Hong-chen  SUN Yong-juan  WU Geng  HOU Wei-guo  DONG Hai-liang  LAI Zhong-ping
Affiliation:1,3(1.Qinghai Institute of Salt Lakes,Chinese Academy of Sciences,Xining,810008,China; 2.State Key Laboratory of Biogeology and Environmental Geology,China University of Geosciences, Wuhan,430074,China;3.Cold and Arid Regions Environmental and Engineering Research Institute, Chinese Academy of Sciences,Lanzhou,730000,China; 4.State Key Laboratory of Biogeology and Environmental Geology,China University of Geosciences, Beijing,100083,China; 5.University of Chinese Academy of Sciences,Beijing,100049,China)
Abstract:The abundance and diversity of sulfate-reducing bacteria in sediments collected from six lakes(Erhai Lake,Qinghai Lake,Gahai1 Lake,Gahai2 Lake,Xiaochaidan Lake,and East Dabsan Lake) on Qinghai-Tibet Plateau were investigated by using an integrated approach including polymerase chain reaction(PCR),denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE),and quantitative PCR(qPCR).The results show that the dsrB gene(encoding for β-subunit of the dissimilatory sulfite reductase) abundance in the studied saline lakes ranges from 1.71×108 to 1.55×109 copies per gram of sediments,which did not show apparent relationship with salinity;The retrieved DGGE band sequences were affiliated with Desulfobacteraceae,Desulfobulbaceae and Peptococcaceae,and Desulfobacteraceae sequences were dominant.The DGGE-based dsrB gene diversity decreased as salinity increase.Taken together,salinity may not be the sole factor controlling the abundance and diversity of sulfate reducing bacteria in Qinghai-Tibetan lakes,but other unknown environmental factors may contribute,which awaits further investigation.
Keywords:dsrB gene  DGGE  Sulfate-reducing bacteria  Qinghai-Tibetan lakes
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