基于Label-free技术的非小细胞肺癌蛋白质差异研究 |
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引用本文: | 魏文海,李兴芳,张新迪,周立文,赵琼,李静芸,牛慧敏.基于Label-free技术的非小细胞肺癌蛋白质差异研究[J].内蒙古医学杂志,2023(9):1025-1028+1020+1153. |
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作者姓名: | 魏文海 李兴芳 张新迪 周立文 赵琼 李静芸 牛慧敏 |
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作者单位: | 1. 甘肃中医药大学中西医结合学院;2. 甘肃省中医院肺病科 |
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基金项目: | 甘肃省卫生行业科研计划项目(编号:GSWSKY-2019-30);;甘肃省自然科学基金(编号:21JR11RA209); |
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摘 要: | 目的 基于非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer, NSCLC)及与其配对的非癌性邻近组织(non-cancerous adjacent tissues, NATs)的蛋白质组学分析,寻找NSCLC诊断相关蛋白标志物。方法 应用非标记定量蛋白组学(LFP)技术,以NSCLC患者配对的NATs为对照,对5例NSCLC患者进行癌组织蛋白质组学分析。以差异倍数>1.5(上调)或<0.67(下调)且P<0.05为标准筛选差异蛋白。应用String网站和R语言对差异蛋白进行基因本体论(gene ontology, GO)分析、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)分析,为进一步研究提供良好基础。结果 本研究发现差异蛋白共644个,其中339个蛋白表达上调,305个蛋白表达下调。PCA结果显示,差异蛋白可明显区分NSCLC与NATs。GO分析结果表明,差异蛋白大多以细胞外泌体的形式存在且主要富集于调节胞外分泌、胞外分泌、骨髓细胞激活参与免疫反应等的生物学过程以及钙粘着蛋白绑...
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关 键 词: | 非小细胞肺癌 非标记定量蛋白质组学 新型蛋白标志物 |
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