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可满足问题的分子信标计算模型(英文)
引用本文:殷志祥,崔建中,支凌迎,孙侠,黄晓慧.可满足问题的分子信标计算模型(英文)[J].计算机学报,2008,31(12).
作者姓名:殷志祥  崔建中  支凌迎  孙侠  黄晓慧
作者单位:1. 安徽理工大学理学院,安徽,淮南,232001;华中科技大学控制科学与工程系,武汉,430074
2. 安徽理工大学理学院,安徽,淮南,232001
基金项目:国家自然科学基金 , 国家"八六三"高技术研究发展计划项目基金 , 安徽省优秀人才基金、中国教育部新世纪优秀人才支持计划 , 安徽省教育厅自然科学基金项目  
摘    要:分子信标(Molecular Beacon)是一种发夹状的荧光探针,它可以特异地和那些与分子信标的环(Loop)互补的核酸靶序列杂交,具有单个碱基错配的检测能力.肽核酸(Peptide Nucleic Acid)是人工合成的核酸(DNA)的类似物.PNA骨架为酰胺键,与DNA补链杂交更稳定,可以阻止聚合酶延伸反应.文中将可满足问题的约束变量编码于分子信标的环部识别区,通过分子信标与使得给定范式为真的变量的PNA补链杂交,再利用PNA链可以阻止聚合酶延伸反应的性质,用限制性内切酶EcoRI降解对应于非解的分子信标,最后通过加热表面使分子信标构形发生变化,产生荧光读解.提出的可满足问题的分子信标计算模型具有可靠性高、无需观察和记录计算的中间结果、读解简单等优点.

关 键 词:DNA计算  可满足问题  分子信标  肽核酸  荧光

Molecular Beacon Based DNA Computing Model for General Satisfiability Problem
YIN Zhi-Xiang,CUI Jian-Zhong,ZHI Ling-Ying,SUN Xia,HUANG Xiao-Hui.Molecular Beacon Based DNA Computing Model for General Satisfiability Problem[J].Chinese Journal of Computers,2008,31(12).
Authors:YIN Zhi-Xiang  CUI Jian-Zhong  ZHI Ling-Ying  SUN Xia  HUANG Xiao-Hui
Affiliation:YIN Zhi-Xiang1),2)CUI Jian-Zhong1)ZHI Ling-Ying1)SUN Xia1)HUANG Xiao-Hui1)1)(School of Sience,Anhui University of Science , Technology,Huainan,Anhui 232001)2)(Department of Control Science , Engineering,Huazhong University of Science , Technology,Wuhan 430074)
Abstract:Molecular Beacon is a hairpin-shaped fluorescent probe,which can hybridize with great specificity target sequence that is complement to its loop sequence.The specificity of Molecular Beacon is as high as single base mismatch detection.Peptide Nucleic Acid(PNA)is an artificial synthesized analogue of nature occurring DNA,in which the DNA sugar-phosphate backbone has been replaced by a pseudo-peptide.Thus the hybridization of PNA to complement DNA strand is more specific and stable than that of DNA to DNA.PNA...
Keywords:DNA computing  satisfiability problem  Molecular Beacon  peptide nucleic acid  fluorescence
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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