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4-巯乙基吡啶配基与IgG相互作用的分子模拟研究
引用本文:王红寅,林东强,姚善泾,贠军贤,姚克俭.4-巯乙基吡啶配基与IgG相互作用的分子模拟研究[J].化学学报,2010,68(16).
作者姓名:王红寅  林东强  姚善泾  贠军贤  姚克俭
作者单位:1. 化学工程联合国家重点实验室,浙江大学化学工程与生物工程学系,杭州,310027
2. 绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地,浙江工业大学,杭州,310032
基金项目:国家自然科学基金,新世纪优秀人才支持计划、绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地开放研究基金资助项目 
摘    要:4-巯乙基吡啶(MEP)是一种新型的疏水性电荷诱导层析(HCIC)配基,具有良好的抗体分离性能,采用分子模拟方法研究MEP配基与IgG间的分子相互作用,以探讨HCIC分离机制.先通过分子对接搜索IgG分子Fc片段A链的蛋白表面,确定12个可能与MEP结合的位点区域,然后用分子动力学模拟考察了其中6个位点的结合性能.结果表明,MEP在Fc-A链表面的结合具有疏水倾向性,pH中性条件下,MEP能稳定地结合在TYR319和LEU309附近的位点,并与两者形成氢键作用,该区域具有疏水性极强的口袋结构;其他位点的结合较不稳定,受MEP取向影响大.在pH4.0酸性条件下,原先稳定结合的MEP快速从Fc-A链表面脱离,主要原因是MEP和Fc间的静电排斥作用,以及疏水作用减弱和氢键结合的消失.通过分子模拟方法,从分子水平验证了HCIC独特的作用机理:疏水相互作用主导吸附,静电排斥作用协助解吸.

关 键 词:4-巯乙基吡啶  疏水性电荷诱导层析  结合模式  分子模拟

Molecular Simulation of the Interactions between 4-Mercaptoethyl-pyridine Ligand and IgG
Wang,Hongyin,Lin,Dongqiang,Yao,Shanjing,Yun,Junxian,Yao,Kejian.Molecular Simulation of the Interactions between 4-Mercaptoethyl-pyridine Ligand and IgG[J].Acta Chimica Sinica,2010,68(16).
Authors:Wang  Hongyin  Lin  Dongqiang  Yao  Shanjing  Yun  Junxian  Yao  Kejian
Abstract:
Keywords:IgG
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