急性氨氮胁迫下大口黑鲈的肝脏转录组特征分析 |
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引用本文: | 刘品,王文博,李超,严少普,李琪,罗小敏,张硕华,张艺琛,姚林荣.急性氨氮胁迫下大口黑鲈的肝脏转录组特征分析[J].水生生物学报,2024(5):713-724. |
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作者姓名: | 刘品 王文博 李超 严少普 李琪 罗小敏 张硕华 张艺琛 姚林荣 |
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作者单位: | 1. 咸阳师范学院生命科学系;2. 西安市水产工作站 |
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基金项目: | 国家自然科学基金面上项目(31872175);;陕西省自然科学基金(2021JQ-816); |
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摘 要: | 为研究大口黑鲈(Micropterus salmoides)受到氨氮胁迫时基因表达的变化规律,文章采用Illumina平台的HiSeq测序策略分析了氨氮胁迫12h和24h后大口黑鲈肝脏的基因表达谱。氨氮胁迫后在大口黑鲈肝脏共获得111.66 Gb的有效数据,组装获得133486个单基因簇(Unigenes), N50为1000 bp。通过比较转录组分析在2个时间点共获得2072个差异表达基因,其中氨氮胁迫12h获得1516个差异表达基因, 907个上调, 609个下调;氨氮胁迫24h获得556个差异表达基因,其中330个上调, 226个下调。GO功能注释分析结果表明,在氨氮胁迫12h差异基因富集数目明显多于24h,但在“氧化还原酶活性”条目中富集的差异基因数目则是氨氮胁迫24h多于12h。此外, KEGG功能富集分析发现,氨氮胁迫对大口黑鲈肝脏氧化应激、细胞自噬和凋亡相关等途径产生影响。选取10个差异表达基因进行qPCR验证,其表达水平与转录组差异基因分析结果一致,证明了测序结果的可靠性。其中,与氧化应激相关基因缺氧诱导因子1α (HIF1α)、生长停滞DNA损伤可诱导蛋白β (Gad...
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关 键 词: | 氨氮胁迫 转录组 肝脏 大口黑鲈 |
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