| 油茶IDD基因家族鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 陈健鑫,吴峰婧琳,魏玉倩,杨娅琳,马焕成,杨红玉,伍建榕.油茶IDD基因家族鉴定与生物信息学分析[J].热带作物学报,2024(2):247-258. |
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| 作者姓名： | 陈健鑫 吴峰婧琳 魏玉倩 杨娅琳 马焕成 杨红玉 伍建榕 |
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| 作者单位： | 1. 西南林业大学生物多样性保护学院/云南省高校森林灾害预警控制重点实验室;2. 西南林业大学林学院/西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室;3. 昆明学院农学与生命科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（No.31860208）；;国家重点研发计划项目（No.2019YFD100200X）；;云南省教育厅科学研究基金项目（No.2023Y0720）； |
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| 摘 要： | 油茶（Camelliaoleifera）是山茶科（Theaceae）的一种特有的油料植物，具有重要的观赏价值和经济价值，随着油茶的集约化种植，病虫害大量发生，加之良种选育滞后，严重制约着油茶产业的发展。INDETERMINATE DOMAIN(IDD)家族是高等植物中一类保守的转录因子，通过介导植物内源激素进而调控植物的基础免疫反应。为鉴定油茶中IDD基因家族成员，本研究以油茶全基因组信息为参考，通过IDD基因家族保守结构域鉴定了29个油茶CoIDD基因家族成员，进一步明确了各基因的结构、理化性质、系统进化关系、亚细胞定位。通过RT-PCR克隆到1个与AtIDD4/5/6同源的CoIDD4基因，明确了其理化性质、表达模式及核定位信号，同时分析了其启动区顺式作用元件的类型。研究结果表明，29个CoIDD基因家族成员分为4个亚组，平均亲水系数均小于0，属于亲水性蛋白，且亚细胞定位均位于细胞核内；克隆到CoIDD4基因的全长ORF框包含1620bp碱基，编码539个氨基酸，主要在叶片和花器官中表达；该基因启动子区顺式作用元件主要是参与光响应和植物激素响应元件两大种类。综上所述，本研究在油茶中...
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| 关 键 词： | 油茶 IDD基因家族 生物信息学分析 植物激素 抗性调控 |
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