海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析 |
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引用本文: | 王元,周俊芳,韦信贤,马荣荣,赵姝,李新苍,房文红.海水和淡水养殖凡纳滨对虾肠道和鳃的菌群结构分析[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2018,44(2). |
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作者姓名: | 王元 周俊芳 韦信贤 马荣荣 赵姝 李新苍 房文红 |
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作者单位: | 中国水产科学研究院东海水产研究所/农业部东海渔业资源开发利用重点实验室;广西水产科学研究院;上海海洋大学水产与生命学院 |
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基金项目: | 上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2014)第3–4号);上海市现代虾类产业技术体系专项(沪农科产字[2014]第5号) |
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摘 要: | 运用Miseq高通量测序技术,分析凡纳滨对虾虾苗及其在海水和淡水2种养殖条件下生长到体长9~10 cm时的肠道和鳃的菌群结构。结果显示:虾苗、肠道和鳃样品在门水平上菌群均以厚壁菌门和变形菌门为主,但丰度差异较大;在属水平上,虾苗菌群以乳球菌属(36.1%)、未成功分属的γ–变形菌纲的菌株(25.5%)、芽孢杆菌属(13.5%)、Solibacillus(7.9%)、假单胞菌属(5.0%)和节杆菌属(2.5%)为主,鳃的菌群以乳球菌属、芽孢杆菌属、Solibacillus、假单胞菌属和节杆菌属为主,肠道菌群在海水养殖中的以发光杆菌属(22.9%)、弧菌属(18.2%)、乳球菌属(13.3%)、纤维弧菌属(8.0%)、希瓦氏菌属(5.5%)和芽孢杆菌属(5.4%)为主,而在淡水养殖中的以希瓦氏菌属(57.4%)、乳球菌属(18.8%)和芽孢杆菌属(6.3%)为主,弧菌丰度小于0.1%。养殖条件对凡纳滨对虾鳃中菌群结构影响较小,但对肠道菌群结构影响较大。
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关 键 词: | 凡纳滨对虾 肠道 鳃 海水养殖 淡水养殖 菌群结构 高通量测序 |
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