| 基于RNA-seq的db/db小鼠大脑皮质的转录组学分析 |
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| 引用本文： | 郭宝璐,白涛,郭杰,刘萌萌,杨彩红,章毅,范彦英.基于RNA-seq的db/db小鼠大脑皮质的转录组学分析[J].基础医学与临床,2020,40(1):16-23. |
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| 作者姓名： | 郭宝璐 白涛 郭杰 刘萌萌 杨彩红 章毅 范彦英 |
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| 作者单位： | 山西医科大学 基础医学院 药理教研室,山西 太原030001;山西医科大学 基础医学院 药理教研室,山西 太原030001;山西医科大学 基础医学院 药理教研室,山西 太原030001;山西医科大学 基础医学院 药理教研室,山西 太原030001;山西医科大学 基础医学院 药理教研室,山西 太原030001;山西医科大学 基础医学院 药理教研室,山西 太原030001;山西医科大学 基础医学院 药理教研室,山西 太原030001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;山西省高等学校科技创新项目;山西省重点学科建设经费(FSK-SC);山西省工程重点学科建设计划 |
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| 摘 要： | 目的通过对db/db和野生型(WT)小鼠大脑皮质组织全转录组学分析,探索参与调节2型糖尿病诱导的脑功能障碍的差异表达基因(DEGs)及相关通路和网络。方法取雄性野生型WT和db/db小鼠各9只,在第8和24周检测小鼠的体质量和血糖,之后收集动物大脑皮质进行全转录组测序(RNA-seq),并进行DEGs,GO、KEGG及蛋白互作网络分析。结果与WT组相比,db/db组大脑皮质发生变化的306个转录本中有178个表达上调,128个表达下调。DEGs中,43个上调(如Clcnka和Trim17),59个下调(如Arih1和Nectin-3)。蛋白互作网络图中的13个枢纽基因均下调,且大多属于线粒体编码家族。同时,db/db小鼠在多项GO富集类别中具有显著差异,如细胞过程、细胞部分等。此外,KEGG功能富集结果显示DEGs在代谢、帕金森病(PD)、阿尔茨海默病(AD)等相关通路中高度富集,且这些富集通路中的DEGs主要影响了线粒体氧化磷酸化过程。结论揭示了2型糖尿病与中枢神经系统损伤之间的关系及潜在的相关基因、通路及网络。
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| 关 键 词： | 转录组测序 2型糖尿病 大脑皮质 脑功能障碍 |
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