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水稻花期特异表达基因的cDNA和RNA阵列检测
引用本文:王丽华,邓晔,方永启,谭学林,李德葆.水稻花期特异表达基因的cDNA和RNA阵列检测[J].中国水稻科学,2004,18(3):192-198.
作者姓名:王丽华  邓晔  方永启  谭学林  李德葆
作者单位:1. 浙江大学,生物信息与基因网络研究组,浙江,杭州,310029;福建农林大学,蜂学学院,福建,福州
2. 浙江大学,生物信息与基因网络研究组,浙江,杭州,310029
3. 云南农业大学,稻作研究所,云南,昆明650201
基金项目:浙江省重大科技项目 (0 0 110 2 2 2 4),云南省省院省校教育合作项目
摘    要: 用水稻孕穗期、开花期总mRNA为探针与含有2200个独立基因的cDNA阵列杂交,以检测开花期群体基因的表达谱。结果发现,在所获得的1720个有效克隆当中,有472条基因表达下调(占27.44%),892条为持家基因(占51.86%),356条基因表达上调(占20.70%)。表达上调的基因中有250个功能已知(占14.53%),106个是功能未知的新基因(占6.16%)。其中S 腺苷甲硫氨酸还原酶、查尔酮合酶、酰基载体蛋白Ⅱ基因、过敏反应蛋白、醇溶蛋白、3-酮脂酰载体蛋白合酶Ⅲ和β-D-(1→3)-葡聚糖外水解酶等基因参与水稻开花和胚胎发育过程。为了进一步验证它们与开花过程的相关性,选取查尔酮合酶、酰基载体蛋白Ⅱ、醇溶蛋白、S-腺苷基甲硫氨酸还原酶和过敏反应蛋白等5个基因为探针,与755个水稻RNA斑点阵列进行杂交。结果证实醇溶蛋白和过敏反应蛋白基因受发育调节在乳熟成穗中高表达,查尔酮合酶和S-腺苷基甲硫氨酸还原酶基因在叶片中受光诱导、在根中受缺氮胁迫时高表达。在所有表型中,查尔酮合酶、S-腺苷基甲硫氨酸还原酶和酰基载体蛋白Ⅱ基因有相近的表达趋势,过敏反应蛋白和醇溶蛋白基因的表达趋势也相近。

关 键 词:阵列  水稻  开花  基因  表达谱
文章编号:1001-7216(2004)03-0192-07
收稿时间:1900-01-01;

Monitoring and Analyzing the Genes Specific-Expressed at Flowering Stage of Rice (Oryzasativa)
WANG Li-hua ,DENG Ye ,FANG Yong-qi ,TAN Xue-lin ,LI De-bao.Monitoring and Analyzing the Genes Specific-Expressed at Flowering Stage of Rice (Oryzasativa)[J].Chinese Journal of Rice Science,2004,18(3):192-198.
Authors:WANG Li-hua    DENG Ye  FANG Yong-qi  TAN Xue-lin  LI De-bao
Affiliation:WANG Li-hua 1,2,DENG Ye 1,FANG Yong-qi 1,TAN Xue-lin 3,LI De-bao 1,*
Abstract:
Keywords:array  Oryza sativa  flowering  gene  expression profile
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