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| 焦磷酸测序法检测结直肠癌患者K-ras基因外显子2第12和13密码子点突变 | |
| 引用本文： | 谢国化,姚晓虹,吴萍,沈立松.焦磷酸测序法检测结直肠癌患者K-ras基因外显子2第12和13密码子点突变[J].中华检验医学杂志,2012,35(7). |
| 作者姓名： | 谢国化 姚晓虹 吴萍 沈立松 |
| 作者单位： | 1. 200092,上海交通大学医学院附属新华医院检验科 2. 200092,上海交通大学医学院附属新华医院病理科 3. 200092,上海交通大学医学院附属新华医院普外科 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，上海市科委重点项目资助课题 |
| 摘 要： | 目的 探讨焦磷酸测序法检测结直肠癌患者肿瘤组织K-ras基因外显子2第12和13密码子点突变方法的临床应用价值.方法 以已知K-ras基因突变的结直肠癌细胞株SW480、DLD-1和野生型细胞株HT-29 DNA作为测序模板检验焦磷酸测序法的准确性.对含不同比例(2％、3％、5％、10％、20％、30％和50％)结直肠癌细胞株K-ras基因的DNA混合样本采用焦磷酸测序法进行基因突变率检测,并与Sanger测序结果平行进行Fisher精确检验比较,评价其灵敏度.同时用焦磷酸测序法检测分析30份临床结直肠癌患者石蜡包埋组织中K-ras基因第12和13密码子突变.结果 当混合已知突变类型的结直肠癌细胞株K-ras基因的DNA样本突变DNA比例在5％和10％浓度时,Sanger测序法检出K-ras基因突变率分别为33.3％ (4/12)和58.3％ (7/12),焦磷酸测序法分别为91.7％(11/12)和100％( 12/12),且2种方法检出K-ras基因突变率的差异有统计学意义(P＜0.05).此外,用焦磷酸测序法从30例结直肠癌患者石蜡包埋组织标本中检出K-ras基因外显子2第12和13密码子突变10例,均为杂合型突变,突变率为33.3％ (10/30).最常见的突变类型为G＞A转换50％(5/1O)]和G＞T颠换(30％(3/10)].结论 焦磷酸测序法检测结直肠癌K-ras基因外显子2第12和13密码子突变具有敏感、准确的优点,可用于临床个体化治疗中肿瘤基因突变检测. |
| 关 键 词： | 结直肠肿瘤 基因 ras 外显子 突变 序列分析 DNA |
Genotyping of K-ras exon 2 codons 12 and 13 mutations in colorectal cancer by pyrosequencing |
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| XIE Guo-hua , YAO Xiao-hong , WU Ping , SHEN Li-song.Genotyping of K-ras exon 2 codons 12 and 13 mutations in colorectal cancer by pyrosequencing[J].Chinese Journal of Laboratory Medicine,2012,35(7). | |
| Authors: | XIE Guo-hua YAO Xiao-hong WU Ping SHEN Li-song |
| Abstract: | |
| Keywords: | Colorectal neoplasms Genes ras Exons Mutation Sequence analysis DNA |
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