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汉滩病毒西安分离株84 FLi的S片段全基因序列测定及分析
引用本文:李新红,杨为松,杭长寿,白雪帆,马本江,黄长形.汉滩病毒西安分离株84 FLi的S片段全基因序列测定及分析[J].医学研究生学报,2004,17(3):197-199,203.
作者姓名:李新红  杨为松  杭长寿  白雪帆  马本江  黄长形
作者单位:1. 第四军医大学唐都医院解放军感染病诊治中心,陕西西安,710038
2. 中国预防医学科学院病毒学研究所,北京,100052
基金项目:国家自然科学基金资助课题 (批准号:30200010)
摘    要:目的:测定我国陕西西安出血热肾病综合征(HFRS)患者流产胎儿肝分离的病毒84FLi株的全S片段基因序列,了解其分子特征,并确定其在汉坦病毒(HV)种系发生中的位置。方法:采用逆转录.聚合酶链式反应(RT-PCR),扩增出S基因的cDNA,直接用PCR产物或克隆入pMD18-T载体中测序。结果:84FLi株的全S基因共由1688个核苷酸组成,四种核苷酸的比例分别为A31.39%、C19.25%、G23.04%和T26.30%,GC含量为42.29%,AT含量为57.71%。最大开放读码框为37~1326,共编码429个氨基酸。核苷酸序列同源性分析表明,84FLi株与汉滩病毒(HTN)型同源性高于与其他型HTV的同源性。84FLi株与中国毒株Chen4和RG9同属于一个进化分支,而与HTN型国外毒株距离较远,属于不同的进化分支。结论:84FLi株属于HTN,并与国内分离的HTN同源性较高。

关 键 词:汉坦病毒  序列分析  系统发生树  84FLi株
文章编号:1008-8199(2004)03-0197-03

Sequencing and analysing of complete S segment of 84 FLi,a Hantaan virus isolated from Xi'an
LI Xin-hong ,YANG Wei-song ,HANG Chang-shou ,BAI Xue-fan ,MA Ben-jiang ,HUANG Chang-xing.Sequencing and analysing of complete S segment of 84 FLi,a Hantaan virus isolated from Xi''''an[J].Bulletin of Medical Postgraduate,2004,17(3):197-199,203.
Authors:LI Xin-hong  YANG Wei-song  HANG Chang-shou  BAI Xue-fan  MA Ben-jiang  HUANG Chang-xing
Affiliation:LI Xin-hong 1,YANG Wei-song 1,HANG Chang-shou 2,BAI Xue-fan 1,MA Ben-jiang 2,HUANG Chang-xing 1
Abstract:
Keywords:Hantavirus  Sequence analysis  Phylogenetic tree  Strain 84 FLi
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